mRNA-seq (NGS) עם גנום התייחסות
RNA-seq הוא כלי סטנדרטי בכל מדעי החיים והיבול, המגשר על הפער בין גנומים לפרוטאומים. כוחו טמון בגילוי תמלילים חדשים ובכימות הביטוי שלהם במבחן אחד. הוא נמצא בשימוש נרחב עבור מחקרים תעתיקים השוואתיים, שופכים אור על גנים הקשורים לתכונות או פנוטיפים שונים, כמו השוואה של מוטנטים לסוגי פרא או חשיפת ביטוי גנים בתנאים ספציפיים. BMKCloud mRNA(Reference) APP משלבת כימות ביטוי, ניתוח ביטוי דיפרנציאלי (DEG) וניתוח מבנה רצף בצינור הביואינפורמטיקה mRNA-seq(NGS) ומאחדת את החוזקות של תוכנות דומות, מה שמבטיח נוחות וידידותיות למשתמש. משתמשים יכולים להעלות את נתוני ה-RNA-seq שלהם לענן, שם האפליקציה מציעה פתרון מקיף לניתוח ביואינפורמטי. בנוסף, הוא נותן עדיפות לחוויית הלקוח, ומציע פעולות מותאמות אישית המותאמות לצרכים הספציפיים של המשתמשים. משתמשים יכולים להגדיר פרמטרים ולהגיש את משימת הצינור בעצמם, לבדוק את הדוח האינטראקטיבי, לצפות בנתונים/דיאגרמות ולהשלים את כריית הנתונים, כגון: בחירת גן מטרה, אשכולות פונקציונליים, דיאגרמות וכו'.
פּלַטפוֹרמָה:אילומינה, MGI
אִסטרָטֶגִיָה:RNA-Seq
מַעֲרָך: זוג, נתונים נקיים.
סוג ספרייה:fr-unstranded, fr-firststrand או fr-secondstrand
אורך קריאה:150 bp
סוג קובץ:*.fastq, *.fq, *.fastq.gz או *.fq.gz. המערכת תעשה זאתהתאמה אוטומטית של קבצי ה-fastq בהתאם לשמות הקבצים שלהם,למשל *_1.fastq בשילוב עם *._2.fastq.
מספר דוגמאות:אין הגבלות על המספרשל דגימות, אך זמן הניתוח יגדל ככל שמספר הדגימותדגימות גדלות.
כמות נתונים מומלצת:6G לדגימה