רצף Transcriptome באורך מלא מבוסס Nanopore
ריצוף Nanopore מבדיל את עצמו מפלטפורמות ריצוף אחרות, בכך שהנוקלאוטידים נקראים ישירות ללא סינתזת DNA ויוצר קריאות ארוכות בעשרות קילובסיסים. זה מאפשר קריאה ישירה של תמלילים באורך מלא והתמודדות עם האתגרים במחקרי תעתיק.
√ הטיה נמוכה ספציפית לרצף
√ קריאה באורך מלא של cDNA למחקרי מבנה גנים
√ פחות נתונים נדרשים לכיסוי אותו מספר תמלילים
√ זיהוי מספר איזופורמים לכל גן
√ כימות ביטוי ברמת איזופורמה
צינור ביואינפורמטיקה טיפוסי
מקרים מוצלחים אחרונים עם טכנולוגיות Biomarker
1. ניתוחים השוואתיים של תעתיקים באורך מלא חושפים דינמיקה התפתחותית של גזע Gnetum luofuense
כתב עת: Frontiers in Genetics
פורסם: מרץ 2021
מילות מפתח: MinION | שחבור אלטרנטיבי | APA | lncRNA | תמלילים בעלי ביטוי דיפרנציאלי
קרא את הטקסט המלא
2. תנועה חד-כיוונית של RNAs קטנים משרצים לשורשים ב-interspecific heterografts
כתב עת: Nature Plants
פורסם: ינואר 2021
מילות מפתח: Nanopore | אילומינה | זיהוי mRNA נייד באורך מלא
3. ניתוח תעתיק באורך מלא של שורשי אספרגוס חושף את המנגנון המולקולרי של סבילות למלח המושרה על ידי פטריות מיקוריזליות.
כתב עת: בוטניקה סביבתית וניסויית
פורסם: ינואר 2021
מילות מפתח: MinION | תמלילים בעלי ביטוי דיפרנציאלי | גורמי תמלול | שחבור אלטרנטיבי
4. שינויים אופייניים פיזיולוגיים ותעתיק באורך מלא של שורשים ועלים של ורד (Rosa chinensis) בתגובה ללחץ בצורת
כתב עת: פיזיולוגיה של צמחים ותאים
פורסם: אוקטובר 2020
מילות מפתח: PromethION | תמלילים בעלי ביטוי דיפרנציאלי | חיזוי פונקציונלי | איזופורמים שחבורים | TF ו-lncRNA
5. ניתוח והשוואה מקיפה של PacBio ורצף RNA מבוסס ננו-פוריות של התעתיק Arabidopsis
כתב עת: שיטת הצמח
פורסם: אפריל 2020
מילות מפתח: GridION | PromethION | PacBio המשך | Illumina NovaSeq | יישור הגנום | זיהוי תמלול | שחבור אלטרנטיבי | SSR | LncRNA | כימות איזופורם
חדשות ודגשים שואפת לחלוק את המקרים המוצלחים האחרונים עם Biomarker Technologies, ללכוד הישגים מדעיים חדשים כמו גם טכניקות בולטות שיושמו במהלך המחקר.
זמן פרסום: ינואר-08-2022