גנום

הרכבה וניתוח בקנה מידה כרומוזום של יבול ביומסה Miscanthus lutarioriparius גנום
רצף ננופור | Illumina | HI-C | רצף RNA | תוֹלְדוֹת הַגֶזַע
במחקר זה, Biomarker Technologies סיפקו תמיכה טכנית על רצף ננו-פור, הרכבת הגנום של דה נובו, הרכבה בסיוע HI-C וכו '.
תַקצִיר
Miscanthus, צמח רב שנתי של קנה שולי, בעל פוטנציאל רב לייצור ביו -אנרגיה בגלל הביומסה הגבוהה והסובלנות שלו. אנו מדווחים על הרכבה בקנה מידה כרומוזום שלMiscanthus lutarioripariusגנום על ידי שילוב של רצף ננו-ננופור של אוקספורד וטכנולוגיות Hi-C. מכלול 2.07-GB מכסה 96.64% מהגנום, עם Contig N50 של 1.71 מגה-בייט. רצפי המרכז והטלומר מורכבים עבור כל 19 הכרומוזומים והכרומוזום 10, בהתאמה. מקור ה- Allotetraploid של M. lutarioriparius מאושר באמצעות חזרות לוויין צנטרומריות. מודגמים בבירור את מבנה הגנום הטטראפלואידי ומספר סידור מחדש כרומוזומלי ביחס לסורגום. טנדם כפול גנים שלM. Lutarioripariusהם מועשרים פונקציונליים לא רק במונחים הקשורים לתגובת לחץ, אלא ביוסינתזה של דופן התא. משפחות גנים הקשורות להתנגדות למחלות, ביוסינתזה של דופן התא והובלת יון מתכתיות מורחבות מאוד ומתפתחות. התרחבותן של משפחות אלה עשויה להיות בסיס גנומי חשוב לשיפור תכונות מדהימות שלM. Lutarioriparius.
נתונים סטטיסטיים מרכזיים של הרכבת הגנום


דְמוּת. סקירה כללית של מכלול הגנום M. lutarioriparius
חדשות והדגשים נועד לשתף את המקרים המוצלחים האחרונים עם טכנולוגיות ביו -סמן, לכידת הישגים מדעיים חדשים כמו גם טכניקות בולטות המיושמות במהלך המחקר.
זמן הודעה: ינואר -05-2022