איזופורמים אלטרנטיביים מורכבים ומשתנים באורגניזמים הם מנגנונים גנטיים חשובים לוויסות ביטוי גנים ומגוון חלבונים. זיהוי מדויק של מבני תמלול הוא הבסיס למחקר מעמיק של דפוסי ויסות ביטוי גנים. פלטפורמת רצף Nanopore הביאה בהצלחה מחקר טרנסקריפטומי לרמת איזופורם. פלטפורמת ניתוח זו נועדה לנתח נתוני RNA-Seq שנוצרו בפלטפורמת ננו-פור על בסיס גנום התייחסות, אשר משיג ניתוחים איכותיים וכמותיים הן ברמת הגנים והן ברמת התמלילים.