טרנסקריפטום באורך מלא של ננופור

רצף טרנסקריפטום של ננו-פור הוא שיטה עוצמתית לרצף CDNA באורך מלא, זיהוי מדויק וכימות איזופורמים לתמלול. צינור הטרנסקריפטום באורך מלא של BMKCloud באורך מלא נועד לנתח נתוני RNA-Seq שנוצרו בפלטפורמת ננו-פור כנגד גנום התייחסות איכותי ומוטרד היטב, ומספק ניתוח איכותי וכמותי הן ברמת הגן והן ברמת התמליל. לאחר בקרת איכות, מתקבלים רצפי שאינם כיסיריים (FLNC) באורך מלא וממופים רצפי קונצנזוס לגנום ההתייחסות להסרת תמלילים מיותרים. ממערך התמלול הזה, הביטוי מכמת ומזוהים גנים ותמלילים המובעים באופן דיפרנציאלי ומוצגים מבחינה תפקודית. הצינור כולל גם ניתוח אלטרנטיבי של פוליאדנילציה (APA), ניתוח שחבור אלטרנטיבי, ניתוח חוזר רצף פשוט (SSR), חיזוי של lncRNA ומטרות תואמות, חיזוי של רצפי קידוד (CDS), ניתוח משפחת גנים, ניתוח גורמי שעתוק, חיזוי של גנים חדשים והערה תפקודית של תמלילים.