טרנסקריפטום הוא הקשר בין מידע גנטי גנומי לבין פרוטאום של התפקוד הביולוגי. ויסות רמת התמלול הוא מצב הרגולציה החשוב ביותר והנחקר ביותר של אורגניזמים. רצף טרנסקריפטום יכול לרצף את הטרנסקריפטום בכל נקודת זמן או בתנאי כלשהו, כאשר רזולוציה מדויקת לנוקלאוטיד יחיד. זה יכול לשקף באופן דינמי את רמת התמלול של הגנים, לזהות בו זמנית ולכמת תמלילים נדירים ונורמליים, ולספק את המידע המבני של לדוגמא תמלילים ספציפיים.
נכון לעכשיו, טכנולוגיית רצף טרנסקריפטום נמצאת בשימוש נרחב באגרונומיה, רפואה ותחומי מחקר אחרים, כולל ויסות התפתחות של בעלי חיים וצמחים, הסתגלות סביבתית, אינטראקציה חיסונית, לוקליזציה של גנים, התפתחות גנטית של מינים וגילוי מחלות גנטיות וגנטיות.