mRNA-seq (NGS) – De novo

רצף mRNA מאפשר יצירת פרופילים של כל תמלול ה-mRNA בתאים בתנאים ספציפיים ומהווה טכנולוגיה בשימוש נרחב בתחומי מחקר שונים. צינור BMKCloud De novo mRNA-seq נועד לנתח ספריות רצף מועשרות ב-poly-A כאשר אין גנום ייחוס זמין. הצינור מתחיל בבקרת איכות, ואחריודה נובוהרכבת תמלול ובחירת סט יוניגן. ניתוח המבנה האוניגני מנבא רצף קידוד (CDS) וחזרות רצף פשוטות (SSR). לאחר מכן, ניתוח הביטוי הדיפרנציאלי מוצא בין התנאים שנבדקו גנים המבוטאים בצורה דיפרנציאלית, ואחריו ביאור פונקציונלי והעשרה של DEG כדי לחלץ תובנות ביולוגיות.