מטאגנומיקה (NGS)

מטאנומיקה של רובה ציד עם Illumina היא כלי פופולרי לחקר מיקרוביום על ידי ריצוף ישיר של DNA מדגימות מורכבות, מה שמאפשר חקר המגוון הטקסונומי והפונקציונלי כאחד. הצינור המטאנומי של BMKCloud (NGS) מתחיל בבקרת איכות והרכבת מטאנומים, שממנו גנים חזויים ומקובצים במקבצים למערכי נתונים לא מיותרים שמוסמנים לתפקוד ולטקסונומיה באמצעות מסדי נתונים מרובים. מידע זה משמש לניתוח גיוון טקסונומי בתוך המדגם (גיוון אלפא) וגיוון בין המדגם (גיוון בטא). ניתוח דיפרנציאלי בין קבוצות מוצא OTUs ותפקודים ביולוגיים הנבדלים בין שתי הקבוצות באמצעות מבחנים פרמטריים ולא פרמטריים כאחד, בעוד שניתוח מתאם מתייחס להבדלים אלו לגורמים סביבתיים.