אינקרנה

RNA ארוכים שאינם מקודדים (lncRNA) הם RNA ארוכים מ-200 נוקלאוטידים עם פוטנציאל קידוד נמוך אך עם פונקציות רגולטוריות קריטיות. צינור ה-lncRNA של BMKCloud נועד לנתח ספריות מדוללות rRNA עם גנום ייחוס באיכות גבוהה, מוער היטב, על ידי ניתוח ביטוי lncRNA ו-mRNA יחד. לאחר חיתוך קריאה ובקרת איכות, קריאות מיושרות לגנום הייחוס כדי להרכיב תמלילים, וניתוח מבנה הגנים שלאחר מכן חושף שחבור חלופי וגנים חדשים. תעתיקים מזוהים כ-mRNA או lncRNA, וניתוח ביטוי דיפרנציאלי מזהה lncRNAs המבוטא דיפרנציאלי, מטרותיהם וגנים מבוטאים דיפרנציאליים (DEGS). הן DEGs והן יעדי lncRNA בעלי ביטוי דיפרנציאלי מסומנים פונקציונלית כדי למצוא קטגוריות פונקציונליות מועשרות.