ניתוח אגודות לכל הגנום
זרימת עבודה
יתרונות השירות
●רישומי מומחיות ופרסומים נרחבים: עם ניסיון מצטבר ב-GWAS, BMKGene השלימה מאות פרויקטים של מינים במחקר GWAS של אוכלוסיות, סייעה לחוקרים לפרסם יותר מ-100 מאמרים, ומקדם ההשפעה המצטבר הגיע ל-500.
● ניתוח ביואינפורמטיקה מקיף: זרימת העבודה כוללת ניתוח אסוציאציות של SNP, מתן קבוצה של גנים מועמדים והביאור תפקודי התואם שלהם.
●צוות ביואינפורמטיקה מיומן ומחזור ניתוח קצר: עם ניסיון רב בניתוח גנומי מתקדם, הצוות של BMKGene מספק ניתוחים מקיפים עם זמן אספקה מהיר.
●תמיכה לאחר מכירה:המחויבות שלנו משתרעת מעבר להשלמת הפרויקט עם תקופת שירות של 3 חודשים לאחר המכירה. במהלך תקופה זו, אנו מציעים מעקב אחר הפרויקט, סיוע בפתרון בעיות ומפגשי שאלות ותשובות כדי לטפל בכל שאלה הקשורה לתוצאות.
מפרטי שירות ודרישות
| סוג של רצף | סולם אוכלוסין מומלץ | אסטרטגיית רצף | דרישות נוקלאוטידים |
| רצף הגנום השלם | 200 דוגמאות | פי 10 | ריכוז: ≥ 1 ng/ µL כמות כוללת ≥ 30ng השפלה או זיהום מוגבל או ללא |
| קטע מוגבר של לוקוס ספציפי (SLAF) | עומק תג: 10x מספר תגים: < 400 Mb: WGS מומלץ < 1Gb: 100K תגים 1Gb > 2Gb: 300K תגים מקסימום 500 אלף תגים | ריכוז ≥ 5 ng/µL כמות כוללת ≥ 80 ננוגרם Nanodrop OD260/280=1.6-2.5 ג'ל אגרוז: פירוק או זיהום ללא או מוגבל
|
בחירת חומרים
זנים שונים, תת-מינים, גזעים ארץ / גנים / משפחות מעורבות / משאבי בר
זנים שונים, תת-מינים, גזעים יבשתיים
משפחת אחים למחצה/משפחה של אח מלא/ משאבי פרא
זרימת עבודה בשירות
עיצוב ניסוי
משלוח לדוגמא
מיצוי RNA
בניית ספרייה
רצף
ניתוח נתונים
שירותים לאחר המכירה
כולל את הניתוח הבא:
- ניתוח אסוציאציות רחב הגנום: מודל LM, LMM, EMMAX, FASTLMM
- ביאור פונקציונלי של גנים מועמדים
ניתוח אסוציאציות של SNP-trait – עלילת מנהטן
ניתוח אסוציאציות SNP-trait – עלילת QQ
חקור את ההתקדמות שמאפשרת שירותי de GWAS של BMKGene באמצעות אוסף של פרסומים:
לב, ל. ועוד. (2023) 'תובנה לגבי הבסיס הגנטי של סבילות לאמוניה בצדפת הגילוח Sinonovacula constricta על ידי מחקר אסוציאציות רחב גנום',חקלאות מים, 569, עמ'. 739351. דוי: 10.1016/J.AQUACULTURE.2023.739351.
לי, X. et al. (2022) 'ניתוחים מולטי-אומיקים של 398 כניסות של דוחן זנב שועל חושפים אזורים גנומיים הקשורים לביות, תכונות מטבוליטים והשפעות אנטי דלקתיות',צמח מולקולרי, 15(8), עמ' 1367–1383. doi: 10.1016/j.molp.2022.07.003.
Li, J. et al. (2022) 'מיפוי אגודות רחב של גנים של פנוטיפים של חולס בקושי בסביבת בצורת',גבולות במדעי הצמח, 13, עמ'. 924892. doi: 10.3389/FPLS.2022.924892/BIBTEX.
Zhao, X. et al. (2021) 'GmST1, המקודד לסולפוטרנספראז, מקנה עמידות לזני נגיף פסיפס פולי סויה G2 ו-G3',צמח, תא וסביבה, 44(8), עמ' 2777–2792. doi: 10.1111/PCE.14066.
