רצף mRNA באורך מלא
תכונות
● לכידת mRNA של פולי-A ואחריו סינתזת cDNA והכנת הספרייה
● רצף של התמלילים באורך מלא
● ניתוח ביו -אינפורמטי המבוסס על יישור לגנום התייחסות
● ניתוח ביו-אינפורמטי כולל לא רק ביטוי בגן וברמת האיזופורם אלא גם ניתוח של lncRNA, פיוז'ן גנים, פולי-אדנילציה ומבנה גנים
יתרונות שירות
●כימות הביטוי ברמת האיזופורם: הפעלת ניתוח ביטוי מפורט ומדויק, חשיפת שינוי שעשוי להיות מסווה בעת ניתוח ביטוי הגנים כולו
●דרישות נתונים מופחתות:בהשוואה לרצף הדור הבא (NGS), רצף ננו-פור מציג דרישות נתונים נמוכות יותר, ומאפשר רמות שוות ערך של רוויה בכימות ביטוי גנים עם נתונים קטנים יותר.
●דיוק גבוה יותר של כימות הביטוי: גם ברמת הג'ין וגם באיזופורם
●זיהוי מידע טרנסקריפטומי נוסף: פוליאדנילציה אלטרנטיבית, גני היתוך ו- LCNRNA וגני היעד שלהם
●מומחיות נרחבת: הצוות שלנו מביא שפע של ניסיון לכל פרויקט, לאחר שסיים מעל 850 פרויקטים של טרנסקריפטום באורך מלא של ננופור ועיבד מעל 8,000 דוגמאות.
●תמיכה לאחר מכירה: המחויבות שלנו משתרעת מעבר לסיום הפרויקט עם תקופת שירות לאחר המכירה של 3 חודשים. במהלך תקופה זו אנו מציעים מעקב אחר פרויקטים, סיוע לפתרון בעיות ומפגשי שאלות ותשובות כדי להתייחס לשאלות הקשורות לתוצאות.
דרישות לדוגמא ומסירה
| סִפְרִיָה | אסטרטגיית רצף | נתונים מומלצים | בקרת איכות |
| פולי מועשר | Illumina PE150 | 6/12 GB | ציון איכות ממוצע: Q10 |
דרישות לדוגמא:
נוקלאוטידים:
| Conc. (Ng/μl) | כמות (מיקרוגרם) | טוֹהַר | שְׁלֵמוּת |
| ≥ 100 | ≥ 1.0 | OD260/280 = 1.7-2.5 OD260/230 = 0.5-2.5 זיהום מוגבל או ללא חלבון או DNA המוצג בג'ל. | לצמחים: rin ≥7.0; לבעלי חיים: rin ≥7.5; 5.0 ≥28s/18s ≥1.0; מוגבלת או ללא גובה בסיס |
● צמחים:
שורש, גזע או עלה כותרת: 450 מ"ג
עלה או זרע: 300 מ"ג
פרי: 1.2 גרם
● בעל חיים:
לב או מעי: 300 מ"ג
קרב או מוח: 240 מ"ג
שריר: 450 מ"ג
עצמות, שיער או עור: 1 גרם
● פרוקי רגליים:
חרקים: 6G
CRUSTACEA: 300 מ"ג
● דם מלא: צינור אחד
● תאים: 106 תאים
משלוח מדגם מומלץ
מכולה: צינור צנטריפוגה של 2 מ"ל (נייר כסף לא מומלץ)
תיוג לדוגמא: קבוצה+שכפול למשל A1, A2, A3; B1, B2, B3.
מִשׁלוֹחַ:
1. קרח יבש: יש לארוז דגימות בשקיות ולקבור בקרח יבש.
2. צינורות רנסטליים: ניתן לייבש דגימות RNA בצינור ייצוב RNA (למשל Rnastable®) ולשלוח בטמפרטורת החדר.
זרימת עבודות שירות
נוקלאוטידים:
משלוח לדוגמא
בניית ספרייה
רצף
ניתוח נתונים
שירותים לאחר מכירה
זרימת עבודות שירות
רִקמָה:
עיצוב ניסוי
משלוח לדוגמא
מיצוי RNA
בניית ספרייה
רצף
ניתוח נתונים
שירותים לאחר מכירה
● עיבוד נתונים גולמיים
● זיהוי תמלול
● שחבור אלטרנטיבי
● כימות ביטוי ברמת הגנים ורמת האיזופורם
● ניתוח ביטוי דיפרנציאלי
● הערה והעשרה של פונקציות (DEGS ו- DETS)
ניתוח שחבור אלטרנטיבי
ניתוח פוליאדנילציה אלטרנטיבי (APA)
חיזוי lncRNA
ביאור של גנים חדשים
אשכול של dets
רשתות חלבון-חלבון ב- DEGS
חקור את ההתקדמות שמאפשרת שירותי רצף mRNA באורך מלא של BMKGene באורך מלא באמצעות אוסף פרסומים אוצר.
Gong, B. et al. (2023) 'הפעלה אפיגנטית ותמלולית של ה- Kinase Fam20c המפרש כאונקוגן בגליומה', Journal of Genetics and Genomics, 50 (6), עמ '422–433. doi: 10.1016/j.jgg.2023.01.008.
הוא, Z. et al. (2023) 'רצף טרנסקריפטום באורך מלא של לימפוציטים מגיב ל- IFN-γ מגלה תגובה חיסונית מסודרת Th1 בפלונדר (paralichthys olivaceus)', אימונולוגיה של דגים ורכיכות, 134, p. 108636. Doi: 10.1016/j.fsi.2023.108636.
MA, Y. et al. (2023) 'ניתוח השוואתי של שיטות רצף RNA של PACBIO ו- ONT לזיהוי ארס Nomopilema Nomurai', Genomics, 115 (6), p. 110709. Doi: 10.1016/j.ygeno.2023.110709.
Yu, D. et al. (2023) 'ניתוח ננו-SEQ מגלה נטייה תפקודית שונה בין אקסוזומים למיקרו-סיביות הנגזרים מ- HUMSC', מחקר ותאי גזע וטיפול, 14 (1), עמ '1–13. doi: 10.1186/s13287-023-03491-5/טבלאות/6.
