ניתוח mRNA Eukaryotic (אפשרויות מבוססות הפניה ו- De Novo זמין)
צינור זה משתמש בנתוני NGS RNA-seq כקלט ומניב תוצאות מניתוחים מרובים במורד הזרם כולל אך לא רק: רצף הערכת איכות נתונים,דה נובוביאור אתר תעתיק, ניתוח שחבור משתנה, ניתוח ביטוי דיפרנציאלי, הערת הפונקציות וניתוח העשרה.
ניתוח RNA ארוך ללא קידוד
RNAs ארוכים שאינם מקודדים (LNCRNA) הם תמלילים שאינם מקודדים עם אורכים ארוכים מ- 200 NT וידועים כממלאים תפקידים בארגון כרומטין ובוויסות. טכנולוגיות רצף תפוקה גבוהה וביואינפורמטי, העצימו את ההבנה של רצפי lncRNA ומידע מיקום כדי לזהות LNCRNAs עם פונקציות רגולטוריות מכריעות. צינור זה מספק ניתוח lncRNA בנוסף לניתוחים המוזכרים בצינור ניתוח ה- mRNA האוקריוטי.
16S/18S/רצף Amplicon שלו
צינור ניתוח הגיוון המיקרוביאלי של Amplicon רצף פותח על סמך ניסיון של שנים בניתוח פרויקטים של מגוון מיקרוביאלי. הצינור מכיל ניתוח בסיסי סטנדרטי, המכסה את תוכן הניתוח המיינסטרימי של מחקר מיקרוביאלי נוכחי וניתוח מותאם אישית. דוח הניתוח עשיר ומקיף, עם האפשרות לבצע ניתוח אישי מגוון. בנוסף, ניתן לשנות דגימות וקבוצות תוך כדי תנועה להתאמה אישית ובקרה נוספים.
ניתוח מטגנומיקה של רובה ציד
צינור הניתוח המטגנומי של רובה הציד משתמש בנתוני NGS מחומרים גנומיים מעורבים המופקים מדגימות סביבתיות. ניתוחים כלולים מספקים מידע מפורט על גיוון ושפע המינים, מבנה האוכלוסייה, קשר פילוגנטי, גנים תפקודיים ורשתות מתאם עם גורמים סביבתיים.
ניתוח גרסאות NGS-WGS
ניתוח הווריאנט NGS-WGS הוא צינור זיהוי גרסאות משולב המבצע בקרת איכות נתונים, יישור רצף, ביאור וניתוח מוטציה של גנים. הצינור עוקב אחר שיטות העבודה המומלצות של GATK לגילוי SNP ו- Indel ומשתמש במנטה לשיחות וריאנטיות מבניות.
מחקר אגודות רחב גנום (GWAS)
צינור ה- GWAS הוא ניתוח במורד הזרם שלוקח קבצי VCF שנוצרו בעבר ונתוני פנוטיפ תואמים עבור קבוצה של אנשים כקלט. באמצעות מתודולוגיות סטטיסטיות ספציפיות, GWAS נועד לחשוף וריאציות נוקלאוטידים רחבי הגנום המתואמים עם הבדלים פנוטיפיים. זה ממלא תפקיד מכריע בבחינת גנים תפקודיים הקשורים למחלות אנושיות מורכבות ותכונות מורכבות בצמחים ובעלי חיים.
ניתוח הפרדה בתפזורת (BSA)
ניתוח BSA כולל איחוד אנשים עם תכונות פנוטיפיות קיצוניות מאוכלוסייה המפרידה. על ידי השוואה בין לוקוסים דיפרנציאליים בין הדגימות המאוחדות, גישה זו מזהה במהירות סמנים מולקולריים קשורים קשר הדוק הקשורים לגני יעד. בשימוש נרחב במיפוי גנטי של צמחים ובעלי חיים, זהו כלי חשוב לגידול בסיוע סמן.
ניתוח גנטיקה אבולוציונית
ניתוח הגנטיקה האבולוציונית זרימת העבודה ממנפת את הניסיון הרחב של BMKGENE בפרויקטים של אבולוציה גנטית וכוללת בניית עצים פילוגנטיים, ניתוח חוסר שיוויון הצמדה, הערכת גיוון גנטי, זיהוי סחף סלקטיבי, ניתוח קרבה, ניתוח רכיבים עיקרי ואפיון מבנה אוכלוסייה.
