רצף mRNA אוקריוטי-NGs
תכונות
● לכידת פולי mRNA לפני הכנת הספרייה
● הכנת ספריית mRNA כיוונית אופציונלית כדי לאפשר קבלת נתוני רצף ספציפיים לגדילים
● ניתוח ביו -אינפורמטי של ביטוי גנים ומבנה התמלול
יתרונות
●מומחיות נרחבת: הצוות שלנו עיבד למעלה מ- 600,000 דגימות ב- BMKGENE, והשתתרע על סוגי מדגם מגוונים כמו תרבויות תאים, רקמות ונוזלי גוף. אנו מביאים שפע של ניסיון לכל פרויקט וסיימנו בהצלחה מעל 100,000 פרויקטים של mRNA-seq בתחומי מחקר שונים.
●בקרת איכות קפדנית: אנו מיישמים נקודות בקרת ליבה בכל השלבים, החל מהכנת מדגם וספריה ועד רצף וביואינפורמטיקה. ניטור קפדני זה מבטיח מסירת תוצאות באיכות גבוהה בעקביות, ומבטיח לך שהפרויקט שלך בידיים אמינות.
●ביאור מקיף: אנו משתמשים במאגרי נתונים מרובים כדי להעיר באופן פונקציונלי את הגנים המובעים באופן דיפרנציאלי (DEGS) ולבצע ניתוחי העשרה תואמים. גישה מקיפה זו מספקת תובנות לגבי התהליכים הסלולריים והמולקולריים העומדים בבסיס תגובת הטרנסקריפטום, ומבטיחים כי יתבשרו במלואם לגבי תוצאות הפרויקט שלכם.
●תמיכה לאחר מכירה: המחויבות שלנו משתרעת מעבר לסיום הפרויקט עם תקופת שירות לאחר המכירה של 3 חודשים. במהלך תקופה זו אנו מציעים מעקב אחר פרויקטים, סיוע לפתרון בעיות ומפגשי שאלות ותשובות כדי להתייחס לשאלות הקשורות לתוצאות.
דרישות לדוגמא ומסירה
| סִפְרִיָה | אסטרטגיית רצף | נתונים מומלצים | בקרת איכות |
| פולי מועשר | Illumina PE150 Dnbseq-t7 | 6 -10 GB | Q30≥85% |
דרישות לדוגמא:
נוקלאוטידים:
| Conc. (Ng/μl) | כמות (מיקרוגרם) | טוֹהַר | שְׁלֵמוּת | |
| ספרייה סטנדרטית | ≥ 10 | ≥ 0.2 | OD260/280 = 1.7-2.5 OD260/230 = 0.5-2.5 זיהום מוגבל או ללא חלבון או DNA המוצג בג'ל. | לצמחים: rin ≥4.0; לבעלי חיים: rin ≥4.5; 5.0 ≥28s/18s ≥1.0; מוגבלת או ללא גובה בסיס |
| ספריית כיוון | ≥ 10 | ≥ 0.2 | OD260/280 = 1.7-2.5 OD260/230 = 0.5-2.5 זיהום מוגבל או ללא חלבון או DNA המוצג בג'ל. | לצמחים: rin ≥4.0; לבעלי חיים: rin ≥4.5; 5.0 ≥28s/18s ≥1.0; מוגבלת או ללא גובה בסיס |
● צמחים:
שורש, גזע או עלה כותרת: 450 מ"ג
עלה או זרע: 300 מ"ג
פרי: 1.2 גרם
●חַיָה:
לב או מעי: 300 מ"ג
קרב או מוח: 240 מ"ג
שריר: 450 מ"ג
עצמות, שיער או עור: 1 גרם
● פרוקי רגליים:
חרקים: 6G
CRUSTACEA: 300 מ"ג
● דם מלא: צינור אחד
● תאים: 106 תאים
משלוח מדגם מומלץ
מכולה: צינור צנטריפוגה של 2 מ"ל (נייר כסף לא מומלץ)
תיוג לדוגמא: קבוצה+שכפול למשל A1, A2, A3; B1, B2, B3 ... ...
מִשׁלוֹחַ:
1. קרח יבש: יש לארוז דגימות בשקיות ולקבור בקרח יבש.
2. צינורות טבלת RNAS: ניתן לייבש דגימות RNA בצינור ייצוב RNA (למשל Rnastable®) ולשלוח בטמפרטורת החדר.
זרימת עבודות שירות
עיצוב ניסוי
משלוח לדוגמא
מיצוי RNA
בניית ספרייה
רצף
ניתוח נתונים
שירותים לאחר מכירה
ביואינפורמטיקה
אוקריוטי זרימת עבודה של ניתוח רצף mRNA
ביואינפורמטיקה
Øבקרת איכות נתונים גולמית
Øיישור גנום התייחסות
Øניתוח מבנה תמלול
Øכימות ביטוי
Øניתוח ביטוי דיפרנציאלי
Øביאור והעשרה של פונקציות
יישור גנום התייחסות
רוויה בנתונים
מתאם מדגם והערכת משכפלים ביולוגיים
גנים שבאו לידי ביטוי באופן דיפרנציאלי (DEGS)
ביאור פונקציונלי של DEGS
העשרה פונקציונלית של DEG
חקור את ההתקדמות המאפשרת על ידי שירותי רצף ה- mRNA האוקריוטיים של BMKGENE, באמצעות אוסף פרסומים אוצר.
Huang, L. et al. (2023) 'Triclosan ו- Triclocarban מחלישים את יכולת הריח של דגי הזהב על ידי הגבלת זיהוי ריח, שיבוש הולכת האות הריח והפריעה לעיבוד מידע על הריח', מחקר מים, 233, p. 119736. Doi: 10.1016/j.watres.2023.119736.
JIA, LJ et al. (2023) 'Aspergillus fumigatus חוטף P11 אנושי כדי להפנות פגוזומים המכילים פטרייה למסלול לא-משדרג', מארח תאים ומיקרוב, 31 (3), עמ '373-388.E10. doi: 10.1016/j.chom.2023.02.002.
ג'ין, ק. ואח '. (2022) 'גורמי שעתוק TCP המעורבים בפיתוח צילומים של במבוק MA (Dendrocalamus latiflorus munro)', גבולות במדעי הצמח, 13, עמ '. 884443. Doi: 10.3389/fpls.2022.884443/bibtex.
Wen, X. et al. (2022) 'הגנום של חרצית לבנדוליפולולום והמנגנון המולקולרי העומד בבסיס סוגי הקפיטולום המגוונים, מחקר גננות, 9. doi: 10.1093/hr/uhab022.
ג'אנג, יוג'י ואח '. (2023) 'ננורקטור מפל לשיפור הטיפול הסונודינמי על סרטן המעי הגס באמצעות הגדלת ROS סינרגיסטית וחסימת אוטופאגיה', ננו היום, 49, עמ '. 101798. Doi: 10.1016/j.nantod.2023.101798.
