ספריות מוכנות מראש של אילומינה
תכונות
●פלטפורמות:Illumina NovaSeq 6000 ו- NovaSeq X Plus
●מצבי רצף:PE150 ו-PE250
●בקרת איכות של ספריות לפני רצף
●רצף נתונים QC ומשלוח:מסירת דוח QC ונתונים גולמיים בפורמט fastq לאחר דה-מולטיפלקס וסינון קריאות Q30
יתרונות השירות
●מגוון שירותי רצף:הלקוח יכול לבחור לרצף לפי נתיב, תא זרימה או לפי כמות הנתונים הנדרשת (רצף נתיב חלקי).
●ניסיון רב בפלטפורמת רצף Illumina:עם אלפי פרויקטים סגורים עם מינים שונים.
●מסירת דוח QC ברצף:עם מדדי איכות, דיוק נתונים וביצועים כלליים של פרויקט הרצף.
●תהליך רצף בוגר:עם זמן אחזור קצר.
●בקרת איכות קפדנית: אנו מיישמים דרישות QC קפדניות כדי להבטיח אספקת תוצאות באיכות גבוהה באופן עקבי.
פלטפורמות לדוגמה
| פּלַטפוֹרמָה | תא זרימה | מצב רצף | יְחִידָה | תפוקה משוערת |
| NovaSeq X | 10B (8 נתיבים) | PE150 | סינגל ליין נתיב חלקי | 375Gb / נתיב |
| 25B (8 נתיבים) | PE150 | סינגל ליין נתיב חלקי | 1000 ג'יגה-בתים/נתיב | |
| NovaSeq 6000 | תא SP Flow (2 נתיבים) | PE250 | תא זרימה סינגל ליין נתיב חלקי | 325-400 M קריאות / נתיב |
| תא S4 Flow (4 נתיבים) | PE150 | תא זרימה סינגל ליין נתיב חלקי | ~800 ג'יגה-בייט / נתיב |
דרישות לדוגמא
| כמות נתונים (X) | ריכוז (qPCR/nM) | כֶּרֶך | |
| רצף נתיב חלקי
| X ≤ 10 Gb | ≥ 1 ננומטר | ≥ 25 μl |
| 10 Gb < X ≤ 50 Gb | ≥ 2 ננומטר | ≥ 25 μl | |
| 50 Gb < X ≤ 100 Gb | ≥ 3 ננומטר | ≥ 25 μl | |
| X > 100 ג'יגה-בייט | ≥ 4 ננומטר | ≥ 25 μl | |
| רצף נתיבים | פר ליין | ≥ 1.5 ננומטר / בריכת ספרייה | ≥ 25 μl / בריכת ספרייה |
בנוסף לריכוז ולכמות הכוללת, נדרשת גם תבנית שיא מתאימה.
הערה: רצף נתיבים של ספריות במגוון נמוך דורש תוספת של PhiX כדי להבטיח קריאת בסיס חזקה.
אנו ממליצים להגיש ספריות מאוחדות מראש כדוגמאות. אם אתה דורש מ-BMKGENE לבצע איגום ספריות, אנא עיין ב
דרישות הספרייה לרצף נתיב חלקי.
גודל הספרייה (מפת שיא)
השיא העיקרי צריך להיות בטווח של 300-450 bp.
לספריות צריך להיות שיא ראשי יחיד, ללא זיהום מתאם וללא דימרי פריימר.
אנא פנה אלינו אם הדוגמאות שלך אינן עומדות בדרישות חומר המוצא.
זרימת עבודה של שירות
בקרת איכות הספרייה
רצף
בקרת איכות נתונים
מסירת פרויקט
דוח QC של הספרייה
דוח על איכות הספרייה מסופק לפני ביצוע הרצף, הערכת כמות הספרייה והפיצול.
דוח QC ברצף
טבלה 1. סטטיסטיקה על נתוני רצף.
| מזהה לדוגמא | BMKID | קריאות גולמיות | נתונים גולמיים (bp) | קריאות נקיות (%) | Q20(%) | Q30(%) | GC(%) |
| C_01 | BMK_01 | 22,870,120 | 6,861,036,000 | 96.48 | 99.14 | 94.85 | 36.67 |
| C_02 | BMK_02 | 14,717,867 | 4,415,360,100 | 96.00 | 98.95 | 93.89 | 37.08 |
איור 1. התפלגות איכות לאורך קריאות בכל מדגם
איור 2. הפצת תוכן בסיסי
איור 3. התפלגות תוכן שנקרא בנתוני רצף
