● דלדול rRNA ואחריו הכנת ספריית כיוונית, מה שמאפשר נתוני רצף ספציפיים לסטרנד.
● זרימת עבודה ביו -אינפורמטית מאפשרת חיזוי circRNA וכימות ביטוי
●ספריות RNA מקיפות יותר:אנו משתמשים בתדלדלות rRNA במקום בהדלדלות RNA ליניארית בהכנתנו לפני הספריה, ומבטיחים כי נתוני הרצף כוללים לא רק circRNA אלא גם mRNA ו- lncRNA, המאפשרים ניתוח משותף של מערכי נתונים אלה
●ניתוח אופציונלי של רשתות RNA אנדוגניות תחרותיות (CERNA): מתן תובנות עמוקות יותר למנגנוני ויסות סלולרי
●מומחיות נרחבת: עם רקורד של עיבוד מעל 20,000 דגימות ב- BMKGENE, המשתרע על סוגי מדגם מגוונים ופרויקטים של lncRNA, הצוות שלנו מביא שפע של ניסיון לכל פרויקט.
●בקרת איכות קפדנית: אנו מיישמים נקודות בקרת ליבה בכל השלבים, החל מהכנת מדגם וספריה ועד רצף וביואינפורמטיקה. ניטור קפדני זה מבטיח מסירת תוצאות באיכות גבוהה בעקביות.
● תמיכה לאחר המכירה: המחויבות שלנו משתרעת מעבר לסיום הפרויקט עם תקופת שירות לאחר המכירה של 3 חודשים. במהלך תקופה זו אנו מציעים מעקב אחר פרויקטים, סיוע לפתרון בעיות ומפגשי שאלות ותשובות כדי להתייחס לשאלות הקשורות לתוצאות.
סִפְרִיָה | פּלַטפוֹרמָה | נתונים מומלצים | נתונים QC |
rRNA ספרייה כיוונית | Illumina PE150 | 16-20 GB | Q30≥85% |
Conc. (Ng/μl) | כמות (מיקרוגרם) | טוֹהַר | שְׁלֵמוּת |
≥ 80 | ≥ 0.8 | OD260/280 = 1.7-2.5 OD260/230 = 0.5-2.5 זיהום מוגבל או ללא חלבון או DNA המוצג בג'ל. | Rin ≥6.0; 5.0 ≥28s/18s ≥1.0; מוגבלת או ללא גובה בסיס |
● צמחים:
שורש, גזע או עלה כותרת: 450 מ"ג
עלה או זרע: 300 מ"ג
פרי: 1.2 גרם
● בעל חיים:
לב או מעיים: 450 מ"ג
קרב או מוח: 240 מ"ג
שריר: 600 מ"ג
עצמות, שיער או עור: 1.5 גרם
● פרוקי רגליים:
חרקים: 9 גרם
CRUSTACEA: 450 מ"ג
● דם מלא:2 צינורות
● תאים: 106 תאים
● סרום ופלזמה: 6 מ"ל
מכולה: צינור צנטריפוגה של 2 מ"ל (נייר כסף לא מומלץ)
תיוג לדוגמא: קבוצה+שכפול למשל A1, A2, A3; B1, B2, B3.
מִשׁלוֹחַ:
1. קרח יבש: יש לארוז דגימות בשקיות ולקבור בקרח יבש.
2. צינורות רנסטליים: ניתן לייבש דגימות RNA בצינור ייצוב RNA (למשל, rnastable®) ולשלוח בטמפרטורת החדר.
ביואינפורמטיקה
חיזוי circRNA: התפלגות כרומוזומלית
Circrnas מבוטא באופן דיפרנציאלי - עלילת הר געש
Circrnas מבוטא באופן דיפרנציאלי - אשכול היררכי
העשרה פונקציונלית של הגנים המארחים של CircRNA
חקור את התקדמות המחקר שמאפשרת שירותי רצף CircRNA של BMKGENE באמצעות אוסף פרסומים אוצר.
Wang, X. et al. (2021) 'CPSF4 מווסת את היווצרות CIRCRNA והשתקת גנים מתווכת microRNA בקרצינומה של הפטוצלולרי', אונקוגן 2021 40:25, 40 (25), עמ '4338–4351. doi: 10.1038/s41388-021-01867-6.
Xia, K. et al. (2023) 'X Transcriptome המגיב OO מגלה את תפקיד ה- RNA133 המעגלי בעמידות למחלות על ידי ויסות הביטוי של אוסאראב באורז', מחקר פיטופתולוגיה, 5 (1), עמ '1–14. doi: 10.1186/s42483-023-00188-8/דמויות/6.
Y, H. et al. (2023) 'CPSF3 מווסת את איזון התמלילים המעגליים והליניאריים בקרצינומה של הפטוצלולרי'. doi: 10.21203/rs.3.rs-2418311/v1.
Zhang, Y. et al. (2023) 'הערכה מקיפה של CircRNAs בקרדיומיופתיה Cirrhotic לפני ואחרי השתלת כבד', Immunopharmacology בינלאומית, 114, p. 109495. Doi: 10.1016/j.intimp.2022.109495.