
CircRNA
RNA מעגליים (circRNAs) הם RNA לא מקודדים היוצרים מבנים מעגליים ובעלי תפקידים רגולטוריים מרובים, כולל תחרות עם miRNA על גני מטרה וקשירת חלבון. צינור ה-BMKCloud circRNA מיועד לניתוח של ספריות מדוללות rRNA עם גנום התייחסות משוער היטב ואיכותי. הניתוח מתחיל עם חיתוך קריאה ובקרת איכות, ולאחר מכן יישור קריאה לגנום הייחוס וחיזוי של circRNAs חדשניים, יחד עם זיהוי של circRNAs ידועים ממאגרי מידע. מטרות ה-miRNA המתאימים ומארחי ה-circRNA מזוהים לאחר מכן. ניתוח ביטוי דיפרנציאלי מגלה circRNAs המבוטא בצורה דיפרנציאלית, והמארחים המתאימים מקבלים הערות פונקציונליות כדי לחלץ פונקציות ביולוגיות מועשרות.
ביואינפורמטיקה
