I piccoli RNA sono un tipo di RNA non codificante corto con lunghezza media di 18-30 nt, tra cui miRNA, siRNA e piRNA. Questi piccoli RNA sono stati riportati in modo massiccio per essere coinvolti in vari processi biologici come la degradazione dell'mRNA, l'inibizione della traduzione, la formazione di eterocromatina, ecc. L'analisi del sequenziamento dei piccoli è stata ampiamente applicata negli studi sullo sviluppo animale/vegetale, la malattia, il virus ecc. La piattaforma di analisi di sequenziamento è costituita da analisi standard e data mining avanzata. Sulla base dei dati RNA-seq, l'analisi standard può raggiungere l'identificazione e la previsione del miRNA, la previsione del gene target di miRNA, l'analisi dell'annotazione e dell'espressione. L'analisi avanzata consente la ricerca e l'estrazione di miRNA personalizzati, la generazione del diagramma di Venn, la costruzione di network geniche miRNA e bersaglio.