Piccolo RNA

I piccoli RNA sono corti RNA non codificanti con una lunghezza media di 18-30 nt, tra cui miRNA, siRNA e piRNA, che svolgono ruoli importanti nei processi normativi. La pipeline SRNA BMKCloud fornisce analisi standard e personalizzate per l'identificazione di miRNA. Dopo aver letto il taglio e il controllo di qualità, le letture sono allineate su più database per classificare gli SRNA e selezionare miRNA e mappati al genoma di riferimento. I miRNA sono identificati in base a database di miRNA noti, fornendo informazioni sulla struttura secondaria, la famiglia miRNA e i geni target. L'analisi dell'espressione differenziale identifica i miRNA espressi in modo differenziale e i corrispondenti geni target sono annotati funzionalmente per trovare categorie arricchite.