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BMKMANU S3000_Trascrittoma spaziale
La trascrittomica spaziale è all’avanguardia nell’innovazione scientifica e consente ai ricercatori di approfondire intricati modelli di espressione genetica all’interno dei tessuti preservandone al tempo stesso il contesto spaziale. Tra varie piattaforme, BMKGene ha sviluppato il chip di trascrittoma spaziale BMKManu S3000, che vanta una risoluzione migliorata di 3,5 µm, raggiungendo la gamma subcellulare e consentendo impostazioni di risoluzione multilivello. Il chip S3000, caratterizzato da circa 4 milioni di spot, utilizza micropozzetti stratificati con perline caricate con sonde di cattura con codice a barre spaziali. Una libreria di cDNA, arricchita con codici a barre spaziali, viene preparata dal chip S3000 e successivamente sequenziata sulla piattaforma Illumina NovaSeq. La combinazione di campioni con codici a barre spaziali e UMI garantisce l'accuratezza e la specificità dei dati generati. Il chip BMKManu S3000 è estremamente versatile e offre impostazioni di risoluzione multilivello che possono essere regolate con precisione in base ai diversi tessuti e ai livelli di dettaglio desiderati. Questa adattabilità posiziona il chip come una scelta eccezionale per diversi studi di trascrittomica spaziale, garantendo un clustering spaziale preciso con un rumore minimo. L'uso della tecnologia di segmentazione cellulare con BMKManu S3000 consente la delimitazione dei dati trascrizionali fino ai confini delle cellule, ottenendo un'analisi che ha un significato biologico diretto. Inoltre, la migliore risoluzione di S3000 si traduce in un numero maggiore di geni e UMI rilevati per cellula, consentendo un'analisi molto più accurata dei modelli di trascrizione spaziale e del clustering delle cellule.
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Librerie predefinite DNBSEQ
DNBSEQ, sviluppata da MGI, è una tecnologia NGS innovativa che è riuscita a ridurre ulteriormente i costi di sequenziamento e ad aumentare la produttività. La preparazione delle librerie DNBSEQ prevede la frammentazione del DNA, la preparazione di ssDNA e l'amplificazione del cerchio rotante per ottenere le nanoball di DNA (DNB). Questi vengono quindi caricati su una superficie solida e successivamente sequenziati mediante sintesi combinatoria sonda-ancora (cPAS). La tecnologia DNBSEQ combina i vantaggi di un basso tasso di errore di amplificazione con l'utilizzo di modelli di errore ad alta densità con nanoball, ottenendo un sequenziamento con produttività e precisione più elevate.
Il nostro servizio di sequenziamento di librerie predefinite consente ai clienti di preparare librerie di sequenziamento Illumina da diverse fonti (mRNA, intero genoma, amplicone, librerie 10x, tra le altre), che vengono convertite in librerie MGI nei nostri laboratori per essere sequenziate in DNBSEQ-T7, consentendo elevate quantità di dati a costi inferiori.
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Interazione della cromatina basata su Hi-C
Hi-C è un metodo progettato per acquisire la configurazione genomica combinando il sondaggio delle interazioni basate sulla prossimità e il sequenziamento ad alto rendimento. Il metodo si basa sulla reticolazione della cromatina con formaldeide, seguita dalla digestione e dalla rilegatura in modo che solo i frammenti legati covalentemente formino prodotti di ligazione. Sequenziando questi prodotti di legatura, è possibile studiare l'organizzazione 3D del genoma. L'Hi-C consente di studiare la distribuzione delle porzioni del genoma che sono poco compattate (compartimenti A, eucromatina) e che hanno maggiori probabilità di essere trascrizionalmente attive, e le regioni che sono più compattate (compartimenti B, eterocromatina). Hi-C può anche essere utilizzato per individuare i domini topologicamente associati (TAD), regioni del genoma che hanno strutture ripiegate e che probabilmente hanno modelli di espressione simili, e per identificare i loop della cromatina, regioni del DNA che sono ancorate insieme da proteine e che sono spesso arricchito di elementi normativi. Il servizio di sequenziamento Hi-C di BMKGene consente ai ricercatori di esplorare le dimensioni spaziali della genomica, aprendo nuove strade per comprendere la regolazione del genoma e le sue implicazioni nella salute e nella malattia.
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Kit TGuide Smart Magnetic Plant RNA
Kit TGuide Smart Magnetic Plant RNA
Purificare l'RNA totale di alta qualità dai tessuti vegetali
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Kit TGuide Smart per RNA sangue/cellule/tessuti
Kit TGuide Smart per RNA sangue/cellule/tessuti
Il kit di reagenti a cartuccia/piastra preriempita per la purificazione di RNA totale ad alta resa, elevata purezza, alta qualità e privo di inibitori da tessuti animali/cellule/sangue intero fresco
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Kit DNA magnetico intelligente per piante TGuide
Kit DNA magnetico intelligente per piante TGuide
Purifica il DNA genomico di alta qualità da vari tessuti vegetali
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Kit TGuide Smart DNA per suolo/feci
Kit TGuide Smart DNA per suolo/feci
Purifica il DNA privo di inibitori di elevata purezza e qualità da campioni di terreno e feci
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Kit di purificazione del DNA intelligente TGuide
Recupera il DNA di alta qualità dal prodotto PCR o dai gel di agarosio.
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Kit TGuide Smart Blood Genomic DNA
Kit TGuide Smart Blood Genomic DNA
Il kit di reagenti cartuccia/piastra preriempita per la purificazione del DNA genomico da sangue e buffy coat
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Kit DNA per tessuti magnetici intelligenti TGuide
Il kit di reagenti cartuccia/piastra preriempita per l'estrazione del DNA genomico da tessuti animali
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Kit DNA universale intelligente TGuide
Il kit di reagenti a cartuccia/piastra preriempita per la purificazione del DNA genomico da sangue, macchie di sangue essiccato, batteri, cellule, saliva, tamponi orali, tessuti animali, ecc.
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Estrattore di acido nucleico TGuide S16
Estrattore di acido nucleico TGuide S16
Strumento da banco facile da usare, 1-8 o 16 campioni allo stesso tempo
Numero di catalogo/imballaggio
Gatto. NO
ID
N. di preparazioni
OSE-S16-AM
1 set
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Soluzione di mRNA a lunghezza intera PacBio 2+3
Sebbene il sequenziamento dell'mRNA basato su NGS sia uno strumento versatile per quantificare l'espressione genica, la sua dipendenza da letture brevi ne limita l'efficacia nelle analisi trascrittomiche complesse. D'altra parte, il sequenziamento PacBio (Iso-Seq) utilizza la tecnologia a lettura lunga, consentendo il sequenziamento delle trascrizioni di mRNA a lunghezza intera. Questo approccio facilita un'esplorazione completa dello splicing alternativo, delle fusioni geniche e della poliadenilazione, sebbene non sia la scelta primaria per la quantificazione dell'espressione genica. La combinazione 2+3 colma il divario tra Illumina e PacBio facendo affidamento sulle letture PacBio HiFi per identificare il set completo di isoforme di trascrizione e sul sequenziamento NGS per quantificare le isoforme identiche.
Piattaforme: PacBio Sequel II/PacBio Revio e Illumina NovaSeq;
