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Trascrittoma di lunghezza pacbio-full (non reference)

Prendendo i dati di sequenziamento delle isoforme delle bioscienze del Pacifico (PacBio) come input, questa app è in grado di identificare sequenze di trascrizioni a lunghezza intera (senza assembly). Mappando sequenze a lunghezza intera contro il genoma di riferimento, le trascrizioni possono essere ottimizzate da geni noti, trascrizioni, regioni codificanti, ecc. In questo caso, è possibile ottenere un'identificazione più accurata delle strutture di mRNA, come la giunzione alternativa, ecc. L'analisi congiunta con i dati di sequenziamento del trascrittoma NGS consente un'annotazione più completa e una quantificazione più accurata nell'espressione a livello di trascrizione, il che avvantaggia in gran parte l'espressione differenziale a valle e l'analisi funzionale.


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