Genetica evolutiva

Gli studi genetici evolutivi mirano a comprendere la traiettoria evolutiva delle popolazioni usando informazioni sul polimorfismo nelle sequenze genomiche. La pipeline di genetica evolutiva BMKCloud è progettata per analizzare i dati WGS o SLAF (Frammento amplificato da Locus specifico da grandi popolazioni. Dopo il controllo di qualità dei dati grezzi, le letture sono allineate al genoma di riferimento e vengono chiamate varianti. La pipeline include la costruzione di alberi filogenetici, l'analisi dei componenti principali (PCA), l'analisi della struttura della popolazione, lo squilibrio del collegamento (LD), l'analisi della sweep selettiva e l'analisi genica candidata.