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Prodotti

Librerie prefabbricate DNBSEQ

DNBSEQ, sviluppato da MGI, è una tecnologia NGS innovativa che è riuscita a diminuire ulteriormente i costi di sequenziamento e ad aumentare il throughput. La preparazione delle librerie DNBSEQ comporta la frammentazione del DNA, la preparazione di ssDNA e l'amplificazione del cerchio di rotolamento per ottenere i nanoblli del DNA (DNB). Questi vengono quindi caricati su una superficie solida e successivamente sequenziate dalla sintesi combinatoria della sonda (CPA). La tecnologia DNBSEQ combina i vantaggi di avere un tasso di errore di amplificazione basso con i modelli di errore ad alta densità con nanoblli, con conseguente sequenziamento con throughput e precisione più elevati.

Il nostro servizio di sequenziamento della biblioteca pre-realizzato consente ai clienti di preparare le librerie di sequenziamento Illumina da diverse fonti (mRNA, intero genoma, amplicon, biblioteche 10x, tra gli altri), che vengono convertite in librerie MGI nei nostri laboratori per essere sequenziati in DNBSEQ-T7, abilitando, abilitando importi di dati elevati a costi inferiori.


Dettagli del servizio

Risultato demo

Caratteristiche

Piattaforma:MGI-DNBSEQ-T7

Modalità di sequenziamento:PE150

Trasferimento di biblioteche Illumina aMgi:Abilitare il sequenziamento di volumi di dati elevati a basso costo.

Controllo di qualità delle librerie prima del sequenziamento.

Dati di sequenziamento QC e consegna:Consegna del rapporto QC e dati grezzi in formato FASTQ dopo le letture Dimultiplexing e Filtering Q30.

 

Vantaggi

Versatilità dei servizi di sequenziamento:Il cliente può scegliere di sequenziare per corsia o quantità di dati.

Output di dati elevati:1500 GB/corsia

Consegna del rapporto QC sequenziamento:Con metriche di qualità, accuratezza dei dati e prestazioni complessive del progetto di sequenziamento.

Processo di sequenziamento maturo:con breve tempo di invasione.

Controllo di qualità rigoroso: implementiamo severi requisiti di controllo qualità per garantire la consegna di risultati costantemente di alta qualità.

 

Requisiti del campione

 

Importo dei dati (x)

Concentrazione (qpcr/nm)

Volume

Corsia parziale

   

X ≤ 10 GB

≥ 1nm

≥ 25 μl

10 gb <x ≤ 50 gb

≥ 2 nm

≥ 25 μl

50 GB <x ≤ 100 GB

≥ 3 nm

≥ 25 μl

X> 100 GB

≥ 4 nm

 

corsia singola

Per corsia

≥ 1,5 nm / pool di libreria

≥ 25 μl / pool di librerie

Oltre alla concentrazione e all'ammontare totale, è richiesto anche un modello di picco adatto.

Nota: il sequenziamento della corsia di librerie a bassa diversità richiede Phix Spike-in per garantire una robusta chiamata di base.

Si consiglia di presentare le librerie pre-polarizzate come campioni. Se hai bisogno di BMKGENE per eseguire il pool di biblioteche, consultare il

Requisiti della libreria per il sequenziamento della corsia parziale.

Dimensione della libreria (mappa di picco)

Il picco principale dovrebbe essere entro 300-450 bp.

Le biblioteche dovrebbero avere un singolo picco principale, nessuna contaminazione dell'adattatore e nessun dimero di primer.

Flusso di lavoro di servizio

campione-preparazione-
Sequenziamento
Analisi dei dati
Sample-QC

  • Precedente:
  • Prossimo:

  • Rapporto QC della biblioteca

    Un rapporto sulla qualità della biblioteca viene fornito prima del sequenziamento, valutare l'importo della libreria e la frammentazione.

     

    Sequenziamento del rapporto QC

     

    Tabella 1. Statistiche sui dati di sequenziamento.

    ID campione

    Bmkid

    Letture Raw

    Dati grezzi (BP)

    Letture pulite (%)

    Q20 (%)

    Q30 (%)

    GC (%)

    C_01

    BMK_01

    22.870.120

    6.861.036.000

    96.48

    99.14

    94.85

    36.67

    C_02

    BMK_02

    14.717.867

    4.415.360.100

    96,00

    98.95

    93.89

    37.08

    Figura 1. Distribuzione della qualità lungo le letture in ciascun campione

    A9

    Figura 2. Distribuzione del contenuto di base

    A10

    Figura 3. Distribuzione dei contenuti di lettura nei dati di sequenziamento

    A11

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