●Piattaforma:MGI-DNBSEQ-T7
●Modalità di sequenziamento:PE150
●Trasferimento di biblioteche Illumina aMgi:Abilitare il sequenziamento di volumi di dati elevati a basso costo.
●Controllo di qualità delle librerie prima del sequenziamento.
●Dati di sequenziamento QC e consegna:Consegna del rapporto QC e dati grezzi in formato FASTQ dopo le letture Dimultiplexing e Filtering Q30.
●Versatilità dei servizi di sequenziamento:Il cliente può scegliere di sequenziare per corsia o quantità di dati.
●Output di dati elevati:1500 GB/corsia
●Consegna del rapporto QC sequenziamento:Con metriche di qualità, accuratezza dei dati e prestazioni complessive del progetto di sequenziamento.
●Processo di sequenziamento maturo:con breve tempo di invasione.
●Controllo di qualità rigoroso: implementiamo severi requisiti di controllo qualità per garantire la consegna di risultati costantemente di alta qualità.
Importo dei dati (x) | Concentrazione (qpcr/nm) | Volume | |
Corsia parziale
| X ≤ 10 GB | ≥ 1nm | ≥ 25 μl |
10 gb <x ≤ 50 gb | ≥ 2 nm | ≥ 25 μl | |
50 GB <x ≤ 100 GB | ≥ 3 nm | ≥ 25 μl | |
X> 100 GB | ≥ 4 nm | ||
corsia singola | Per corsia | ≥ 1,5 nm / pool di libreria | ≥ 25 μl / pool di librerie |
Oltre alla concentrazione e all'ammontare totale, è richiesto anche un modello di picco adatto.
Nota: il sequenziamento della corsia di librerie a bassa diversità richiede Phix Spike-in per garantire una robusta chiamata di base.
Si consiglia di presentare le librerie pre-polarizzate come campioni. Se hai bisogno di BMKGENE per eseguire il pool di biblioteche, consultare il
Requisiti della libreria per il sequenziamento della corsia parziale.
Il picco principale dovrebbe essere entro 300-450 bp.
Le biblioteche dovrebbero avere un singolo picco principale, nessuna contaminazione dell'adattatore e nessun dimero di primer.
Un rapporto sulla qualità della biblioteca viene fornito prima del sequenziamento, valutare l'importo della libreria e la frammentazione.
Tabella 1. Statistiche sui dati di sequenziamento.
ID campione | Bmkid | Letture Raw | Dati grezzi (BP) | Letture pulite (%) | Q20 (%) | Q30 (%) | GC (%) |
C_01 | BMK_01 | 22.870.120 | 6.861.036.000 | 96.48 | 99.14 | 94.85 | 36.67 |
C_02 | BMK_02 | 14.717.867 | 4.415.360.100 | 96,00 | 98.95 | 93.89 | 37.08 |
Figura 1. Distribuzione della qualità lungo le letture in ciascun campione
Figura 2. Distribuzione del contenuto di base
Figura 3. Distribuzione dei contenuti di lettura nei dati di sequenziamento