Biblioteche pre-fatte Illumina
Caratteristiche
●Piattaforme:Illumina Novaseq 6000 e Novaseq X Plus
●Modalità di sequenziamento:PE150 e PE250
●Controllo di qualità delle librerie prima del sequenziamento
●Dati di sequenziamento QC e consegna:Consegna del rapporto QC e dati grezzi in formato FastQ dopo le letture Dimultiplexing e Filtering Q30
Vantaggi del servizio
●Versatilità dei servizi di sequenziamento:Il cliente può scegliere di sequenziare per corsia, cella di flusso o per quantità di dati richiesti (sequenziamento della corsia parziale).
●Vasta esperienza sulla piattaforma di sequenziamento Illumina:con migliaia di progetti chiusi con varie specie.
●Consegna del rapporto QC sequenziamento:Con metriche di qualità, accuratezza dei dati e prestazioni complessive del progetto di sequenziamento.
●Processo di sequenziamento maturo:con breve tempo di invasione.
●Controllo di qualità rigoroso: implementiamo severi requisiti di controllo qualità per garantire la consegna di risultati costantemente di alta qualità.
Piattaforme di esempio
| Piattaforma | Cella di flusso | Modalità di sequenziamento | Unità | Output stimato |
| Novaseq x | 10b (8 corsie) | PE150 | corsia singola Corsia parziale | 375 GB / corsia |
| 25b (8 corsie) | PE150 | corsia singola Corsia parziale | 1000 GB/corsia | |
| Novaseq 6000 | SP Flow Cell (2 corsie) | PE250 | Cella di flusso corsia singola Corsia parziale | 325-400 M Reads / Lane |
| S4 Flow Cell (4 corsie) | PE150 | Cella di flusso corsia singola Corsia parziale | ~ 800 GB / corsia |
Requisiti del campione
| Importo dei dati (x) | Concentrazione (qpcr/nm) | Volume | |
| Sequenziamento della corsia parziale
| X ≤ 10 GB | ≥ 1 nm | ≥ 25 μl |
| 10 gb <x ≤ 50 gb | ≥ 2 nm | ≥ 25 μl | |
| 50 GB <x ≤ 100 GB | ≥ 3 nm | ≥ 25 μl | |
| X> 100 GB | ≥ 4 nm | ≥ 25 μl | |
| Sequenziamento della corsia | Per corsia | ≥ 1,5 nm / pool di libreria | ≥ 25 μl / pool di librerie |
Oltre alla concentrazione e all'ammontare totale, è richiesto anche un modello di picco adatto.
Nota: il sequenziamento della corsia di librerie a bassa diversità richiede Phix Spike-in per garantire una robusta chiamata di base.
Si consiglia di presentare le librerie pre-polarizzate come campioni. Se hai bisogno di BMKGENE per eseguire il pool di biblioteche, fare riferimento a
I requisiti della libreria per il sequenziamento della corsia parziale.
Dimensione della libreria (mappa di picco)
Il picco principale dovrebbe essere entro 300-450 bp.
Le biblioteche dovrebbero avere un singolo picco principale, nessuna contaminazione dell'adattatore e nessun dimero di primer.
Si prega di contattarci se i tuoi campioni non soddisfano i requisiti del materiale di partenza.
Flusso di lavoro di servizio
Controllo della qualità della libreria
Sequenziamento
Controllo della qualità dei dati
Consegna del progetto
Rapporto QC della biblioteca
Un rapporto sulla qualità della biblioteca viene fornito prima del sequenziamento, valutare l'importo della libreria e la frammentazione.
Sequenziamento del rapporto QC
Tabella 1. Statistiche sui dati di sequenziamento.
| ID campione | Bmkid | Letture Raw | Dati grezzi (BP) | Letture pulite (%) | Q20 (%) | Q30 (%) | GC (%) |
| C_01 | BMK_01 | 22.870.120 | 6.861.036.000 | 96.48 | 99.14 | 94.85 | 36.67 |
| C_02 | BMK_02 | 14.717.867 | 4.415.360.100 | 96,00 | 98.95 | 93.89 | 37.08 |
Figura 1. Distribuzione della qualità lungo le letture in ciascun campione
Figura 2. Distribuzione del contenuto di base
Figura 3. Distribuzione dei contenuti di lettura nei dati di sequenziamento
