Bisúlfít raðgreining í heilu erfðamengi (WGBS)
Whole Genome Bisulfite Sequencing (WGBS) stendur sem gullstöðluð aðferðafræði til ítarlegrar könnunar á DNA metýleringu, nánar tiltekið fimmta stöðu í cýtósíni (5-mC), lykilstjórnandi á tjáningu gena og frumuvirkni. Meginreglan sem liggur að baki WGBS felur í sér bísúlfítmeðferð, sem veldur umbreytingu ómetýleraðra cýtósína í úrasíl (C í U), en skilur metýleruð cýtósín eftir óbreytt. Þessi tækni býður upp á upplausn á einum grunni, sem gerir vísindamönnum kleift að rannsaka metýlómið ítarlega og afhjúpa óeðlilegt metýlunarmynstur sem tengist ýmsum sjúkdómum, einkum krabbameini. Með því að nota WGBS geta vísindamenn öðlast óviðjafnanlega innsýn í metýleringarlandslag um allt erfðamengi, sem gefur blæbrigðaríkan skilning á eðlisfræðilegum aðferðum sem liggja til grundvallar fjölbreyttum líffræðilegum ferlum og sjúkdómum.
Þjónustueiginleikar
● Krefst viðmiðunarerfðamengis.
● Lambda DNA er bætt við til að fylgjast með skilvirkni bísúlfítumbreytingar.
● Röðun á Illumina NovaSeq.
Þjónustukostir
●Gullstaðall fyrir DNA metýlerunarrannsóknir: Þessi fullþroska metýleringar umbreytingarvinnslutækni hefur mikla nákvæmni og góða endurgerðanleika.
●Breitt umfang og upplausn á einni grunni:uppgötvun metýleringarstaða á genamengi alls staðar.
●Heill pallur:veita framúrskarandi þjónustu á einni stöð frá úrvinnslu sýna, byggingu bókasafns, raðgreiningu til lífupplýsingagreiningar.
●Víðtæk sérfræðiþekking: þar sem WGBS raðgreiningarverkefnum hefur verið lokið með góðum árangri yfir fjölbreytt úrval tegunda, færir BMKGENE yfir áratug af reynslu, mjög hæft greiningarteymi, alhliða efni og framúrskarandi stuðning eftir sölu.
●Möguleiki á að taka þátt í Transcriptomics Analysis: sem gerir kleift að samþætta greiningu á WGBS með öðrum gögnum um umics eins og RNA-seq.
Dæmi um upplýsingar
| Bókasafn | Röðunaráætlun | Mælt er með gagnaúttak | Gæðaeftirlit |
| Bisulfite meðhöndlað | Illumina PE150 | 30x dýpt | Q30 ≥ 85% Bisúlfít umbreyting > 99% |
Dæmi um kröfur
| Styrkur (ng/µL) | Heildarmagn (µg) | Viðbótarkröfur | |
| Erfðafræðilegt DNA | ≥ 5 | ≥ 400 ng | Takmarkað niðurbrot eða mengun |
Þjónustuverkflæði
Sýnishorn afhending
DNA útdráttur
Bókasafnsbygging
Röðun
Gagnagreining
Gagnaafhending
Inniheldur eftirfarandi greiningu:
● Gæðaeftirlit með hrári röð;
● Kortlagning á viðmiðunarerfðamengi;
● Greining á 5mC metýleruðum basum;
● Greining á metýlerunardreifingu og skýringu;
● Greining á mismunandi metýleruðum svæðum (DMR);
● Hagnýtur skýring á genum sem tengjast DMR.
5mC metýleringargreining: tegundir metýleraðra staða
Metýlering kort. 5mC metýlering erfðamengi dreifing
Skýring á mjög metýleruðum svæðum
Mismunandi metýleruð svæði: tengd gen
Mismunandi metýleruð svæði: skýring á tengdum genum (Gene Ontology)
Kannaðu rannsóknarframfarirnar sem BMKGene auðveldar bísúlfít raðgreiningarþjónustu í heilu erfðamengi í gegnum safn rita.
Fan, Y. o.fl. (2020) „Greining á DNA metýleringarsniðum við þróun beinagrindvöðva sauðfjár með því að nota bísúlfít raðgreiningu í heilu erfðaefni“,BMC Genomics, 21(1), bls. 1–15. Doi: 10.1186/S12864-020-6751-5.
Zhao, X. o.fl. (2022) „Nýjar deoxýríbónsýrumetýleringartruflanir hjá starfsmönnum sem verða fyrir vínýlklóríði“,Eiturefnafræði og iðnaðarheilbrigði, 38(7), bls. 377–388. Doi: 10.1177/07482337221098600
Zuo, J. o.fl. (2020) „Tengsl metýleringar erfðamengis, magns RNA sem ekki er kóða, mRNA og umbrotsefna í þroskaðri tómatávöxtum“,The Plant Journal, 103(3), bls. 980–994. doi: 10.1111/TPJ.14778.
