Small RNA Sequencing-Illumina
Eiginleikar
● Undirbúningur bókasafns felur í sér stærðarvalsskref
● Lífupplýsingagreining miðast við miRNA spá og markmið þeirra
Þjónustukostir
●Alhliða lífupplýsingagreining:Gerir kleift að bera kennsl á bæði þekkt og ný miRNA, auðkenningu miRNA-markmiða og samsvarandi virkniskýringu og auðgun með mörgum gagnagrunnum (KEGG, GO)
●Strangt gæðaeftirlit: Við innleiðum kjarnastýringarpunkta á öllum stigum, frá undirbúningi sýna og bókasafns til raðgreiningar og lífupplýsingafræði. Þetta nákvæma eftirlit tryggir afhendingu stöðugt hágæða niðurstöður.
●Stuðningur eftir sölu: Skuldbinding okkar nær út fyrir verklok með 3ja mánaða þjónustutíma eftir sölu. Á þessum tíma bjóðum við upp á verkefni eftirfylgni, aðstoð við bilanaleit og spurningar og svör til að svara öllum fyrirspurnum sem tengjast niðurstöðunum.
●Víðtæk sérfræðiþekking: Með afrekaskrá með góðum árangri að loka mörgum sRNA verkefnum sem ná yfir 300 tegundir á ýmsum rannsóknarsviðum, færir teymið okkar mikla reynslu í hvert verkefni.
Dæmi um kröfur og afhending
| Bókasafn | Pallur | Mælt er með gögnum | Gagna QC |
| Stærð valin | Illumina SE50 | 10M-20M lestur | Q30≥85% |
Dæmi um kröfur:
Núkleótíð:
| Styrkur (ng/μl) | Magn (μg) | Hreinleiki | Heiðarleiki |
| ≥ 80 | ≥ 0,8 | OD260/280=1,7-2,5 OD260/230=0,5-2,5 Takmörkuð eða engin prótein- eða DNA mengun sýnd á hlaupi. | RIN≥6,0; 5,0≥28S/18S≥1,0; takmörkuð eða engin grunnhækkun |
● Plöntur:
Rót, stilkur eða krónublað: 450 mg
Blað eða fræ: 300 mg
Ávextir: 1,2 g
● Dýr:
Hjarta eða þörmum: 450 mg
Innyfli eða heili: 240 mg
Vöðvar: 600 mg
Bein, hár eða húð: 1,5g
● Liðdýr:
Skordýr: 9g
Krabbadýr: 450 mg
● Heilblóð: 2 rör
● Frumur: 106 frumur
● Sermi og plasma:6 ml
Mælt er með sýnishornafhendingu
Ílát: 2 ml miðflóttahólkur (tini er ekki mælt með)
Merking sýnis: Hópur+afrit td A1, A2, A3; B1, B2, B3.
Sending:
1. Þurrís: Pakka þarf sýnum í poka og grafa í þurrís.
2. RNA-stöðug rör: Hægt er að þurrka RNA-sýni í RNA-stöðugleikaglasi (td RNAstable®) og senda við stofuhita.
Þjónustuverkflæði
Hönnun tilrauna
Sýnishorn afhending
RNA útdráttur
Bókasafnsbygging
Röðun
Gagnagreining
Þjónusta eftir sölu
Lífupplýsingafræði
● Gæðaeftirlit með hráum gögnum
● sRNA flokkun
● Aðlögun að viðmiðunarerfðamengi
● Auðkenning þekkts og nýs miRNA
● Mismunandi miRNA tjáningargreining
● Hagnýtur skýring á miRNA markmiðum
Auðkenning miRNA: uppbygging og dýpt
Mismunandi tjáning miRNA – stigskipting klasa
Virk skýring á marki miRNA sem tjáð er misjafnlega
Kannaðu rannsóknarframfarirnar sem BMKGene sRNA raðgreiningarþjónustan auðveldar í gegnum safn rita.
Chen, H. o.fl. (2023) „Verusýkingar hamla sapónínlífmyndun og ljóstillífun í Panax notoginseng“, Plant Physiology and Biochemistry, 203, bls. 108038. doi: 10.1016/J.PLAPHY.2023.108038.
Li, H. o.fl. (2023) „Próteinið FREE1 sem inniheldur álverið FYVE lén tengist örgjörvaíhlutum til að bæla niður lífmyndun miRNA,“ segir í EMBO, 24(1). doi: 10.15252/EMBR.202255037/SUPPL_FILE/EMBR202255037-SUP-0004-SDATAFIG4.TIF.
Yu, J. o.fl. (2023) 'The MicroRNA Ame-Bantam-3p stjórnar þroska lirfa púpu með því að miða á margfeldi húðþekjuvaxtaþátta 8 gen (megf8) í hunangsflugunni, Apis mellifera', International Journal of Molecular Sciences, 24(6), bls. . 5726. doi: 10.3390/IJMS24065726/S1.
Zhang, M. o.fl. (2018) 'Samþætt greining á MiRNA og genum sem tengjast kjötgæðum sýnir að Gga-MiR-140-5p hefur áhrif á fituútfellingu í vöðva í kjúklingum', Cellular Physiology and Biochemistry, 46(6), bls. 2421–2433. Doi: 10.1159/000489649.
