Minni birgða bísúlfít raðgreining (RRBS)
Minni birgða bisúlfít raðgreining (RRBS) hefur komið fram sem hagkvæmur og skilvirkur valkostur við Whole Genome Bisulfite Sequencing (WGBS) í DNA metýlerunarrannsóknum. Þó að WGBS veiti alhliða innsýn með því að skoða allt erfðamengið í upplausn á einum basa, getur hár kostnaður þess verið takmarkandi þáttur. RRBS dregur markvisst úr þessari áskorun með því að sértækt greina dæmigerðan hluta erfðamengisins. Þessi aðferðafræði byggir á auðgun CpG eyjaríkra svæða með MspI klofnun fylgt eftir með stærðarvali á 200-500/600 bps brotum. Þar af leiðandi eru aðeins svæði sem eru nálægt CpG eyjum raðgreind, en þau sem eru með fjarlægar CpG eyjar eru útilokuð frá greiningunni. Þetta ferli, ásamt bísúlfít raðgreiningu, gerir kleift að greina DNA metýleringu í mikilli upplausn og raðgreiningaraðferðin, PE150, einbeitir sér sérstaklega að endum innskotanna frekar en miðjuna og eykur skilvirkni metýlunarsniðs. RRBS er ómetanlegt tæki sem gerir hagkvæmar DNA-metýleringarrannsóknir kleift og efla þekkingu á erfðafræðilegum aðferðum.
Þjónustueiginleikar
● Krefst viðmiðunarerfðamengis.
● Lambda DNA er notað til að fylgjast með skilvirkni bísúlfítbreytingar.
● Einnig er fylgst með skilvirkni MspI meltingar.
● Tvöföld ensímmelting fyrir plöntusýni.
● Röðun á Illumina NovaSeq.
Þjónustukostir
●Hagkvæmur og skilvirkur valkostur við WGBS: gerir kleift að framkvæma greininguna með lægri kostnaði og með minni sýnishornsþörf.
●Heill pallur:veita framúrskarandi þjónustu á einum stað frá úrvinnslu sýna, byggingu bókasafns og raðgreiningu til lífupplýsingagreiningar.
●Víðtæk sérfræðiþekking: þar sem RRBS raðgreiningarverkefnum hefur verið lokið með góðum árangri yfir fjölbreytt úrval tegunda, færir BMKGENE yfir áratug af reynslu, mjög hæft greiningarteymi, alhliða efni og framúrskarandi stuðning eftir sölu.
Þjónustulýsingar
| Bókasafn | Röðunaráætlun | Mælt er með gagnaúttak | Gæðaeftirlit |
| MspI melt og Bisulfite meðhöndlað safn | Illumina PE150 | 8 Gb | Q30 ≥ 85% Bisúlfít umbreyting > 99% MspI skera skilvirkni > 95% |
Dæmi um kröfur
| Styrkur (ng/µL) | Heildarmagn (µg) |
| |
| Erfðafræðilegt DNA | ≥ 30 | ≥ 1 | Takmarkað niðurbrot eða mengun |
Þjónustuverkflæði
Sýnishorn afhending
Bókasafnsbygging
Röðun
Gagnagreining
Þjónusta eftir sölu
Inniheldur eftirfarandi greiningu:
● Gæðaeftirlit með hrári röð;
● Kortlagning á viðmiðunarerfðamengi;
● Greining á 5mC metýleruðum basum og mótífagreiningu;
● Greining á dreifingu metýleringar og samanburður sýna;
● Greining á mismunandi metýleruðum svæðum (DMR);
● Hagnýtur skýring á genum sem tengjast DMR.
Gæðaeftirlit: skilvirkni meltingar (við kortlagningu erfðamengis)
Gæðaeftirlit: bísúlfítumbreyting (í metýlerunarupplýsingaútdrætti)
Metýleringarkort: 5mC metýleringar erfðamengi útbreiðsla
Samanburður sýnis: Aðalhlutagreining
Differentially Methylated Regions (DMR) greining: hitakort
Kannaðu rannsóknarframfarirnar sem BMKGene auðveldar bísúlfít raðgreiningarþjónustu í heilu erfðamengi í gegnum safn rita.
Li, Z. o.fl. (2022) „Hægt endurforritun í Leydig-líkar frumur með CRISPR virkjun og paracrine þáttum“,PNAS Nexus1(4). doi: 10.1093/PNASNEXUS/PGAC179.
Tian, H. o.fl. (2023) „Genome-wide DNA metýleringargreining á líkamssamsetningu í kínverskum eineggja tvíburum“,European Journal of Clinical Investigation53(11), bls. e14055. doi: 10.1111/ECI.14055.
Wu, Y. o.fl. (2022) „DNA-metýlering og mitti-til-mjöðmhlutfall: rannsókn á tengslarannsókn á kínverskum eineggja tvíburum sem vítt og breitt um ættarfæðuna“,Journal of Endocrinological Investigation, 45(12), bls. 2365–2376. doi: 10.1007/S40618-022-01878-4.
