Hitakort
Heatmap tólið tekur við fylkisgagnaskrá sem inntak og gerir notendum kleift að sía, staðla og flokka gögn. Aðal notkunartilvikið fyrir hitakort er klasagreining á genatjáningarstigi milli mismunandi sýna.
Genaskýring
Genaskýringartólið framkvæmir genaskýringar byggt á röðun FASTA inntaksskráa á móti ýmsum gagnagrunnum.
Basic Local Alignment Search Tool (BLAST)
BLAST tólið er BMKCloud samþætt útgáfa af NCBI BLAST og er hægt að nota til að framkvæma sömu aðgerðir með því að nota gögn sem hlaðið er upp á BMKCloud reikninginn.
CDS_UTR spá
CDS_UTR spá tólið er hannað til að spá fyrir um kóða svæði (CDS) og ókóðun svæði (UTR) í tilteknum umritaröðum byggt á BLAST niðurstöðum gegn þekktum prótein gagnagrunnum og ORF spá niðurstöðum.
Söguþráður Manhattan
Manhattan Plot tólið gerir kleift að sýna miklar sýnitilraunir og er almennt notað í rannsóknum á erfðamengi-víðum tengslarannsóknum (GWAS).
Circos skýringarmynd
CIRCOS Diagram tólið veitir skilvirka mynd af því hvernig erfðafræðilegir eiginleikar dreifast um erfðamengið. Sameiginlegir eiginleikar eru magnbundnir staðsetningar, SNPs, InDels, byggingar- og afritanúmerafbrigði.
Gene Ontology (GO) auðgun
GO auðgunarverkfærið veitir hagnýta auðgunargreiningu. Aðalhugbúnaðurinn í þessu tóli er TopGO-Bioconductor pakkinn, sem inniheldur mismunatjáningargreiningu, GO auðgunargreiningu og sjónrænni niðurstöður.
Vegin samtjáningarnetgreining á genum (WGCNA)
WGCNA er mikið notuð gagnavinnsluaðferð til að uppgötva samtjáningareiningar gena. Það á við um ýmis tjáningargagnasett, þar á meðal örfylki og NGS genatjáningargögn.
InterProScan
InterProScan tólið veitir InterPro próteinraðgreiningu og flokkun.
GO KEGG auðgun
GO KEGG auðgunarverkfærið er hannað til að búa til GO auðgunarsúlurrit, KEGG auðgunarsúlurrit og KEGG auðgunarferil byggt á uppgefnu genasetti og samsvarandi skýringu.