Ekki tilvísun byggð mRNA raðgreining-NG
Eiginleikar
● Handtaka fjöl mRNA fyrir undirbúning bókasafns
● Óháð hvaða tilvísunar erfðamengi: Byggt á de novo samsetningu afrits, sem býr til lista yfir Unigenes sem eru merktir með mörgum gagnagrunnum (NR, Swiss-Prot, Cog, Kog, Eggnog, PFAM, GO, KEGG)
● Alhliða lífupplýsingagreining á tjáningu gena og uppbyggingu uppskriftar
Þjónustu kostir
●Víðtæk sérfræðiþekking: Með afrekaskrá yfir vinnslu yfir 600.000 sýna á BMKGENE, sem spannar fjölbreyttar sýnishornsgerðir eins og frumurækt, vefi og líkamsvökva, fær teymið okkar mikla reynslu í hvert verkefni. Við höfum lokað yfir 100.000 mRNA-seq verkefnum með góðum árangri á ýmsum rannsóknarsviðum.
●Strangt gæðaeftirlit: Við innleiðum kjarnastýringarstig á öllum stigum, allt frá sýnishorni og undirbúningi bókasafns til raðgreiningar og lífupplýsingafræði. Þetta vandlega eftirlit tryggir afhendingu stöðugt vandaðra niðurstaðna.
● Alhliða athugasemd: Við notum marga gagnagrunna til að gera grein fyrir mismunandi genum (Degs) og framkvæma samsvarandi auðgunargreiningu og veita innsýn í frumu- og sameindaferli sem liggja að baki svörun transkriptome.
●Stuðningur eftir sölu: Skuldbinding okkar nær út fyrir lokun verkefnis með 3 mánaða þjónustutímabili eftir sölu. Á þessum tíma bjóðum við upp á eftirfylgni verkefnis, vandræðaleit og spurningar og spurningar til að takast á við allar fyrirspurnir sem tengjast niðurstöðunum.
Dæmi um kröfur og afhendingu
| Bókasafn | Röðunarstefna | Mælt er með gögnum | Gæðaeftirlit |
| Poly auðgað | Illumina PE150 Dnbseq-T7 | 6-10 GB | Q30 ≥85% |
Dæmi um kröfur:
Nucleotides:
| Conc. (Ng/μl) | Magn (μg) | Hreinleiki | Heiðarleiki |
| ≥ 10 | ≥ 0,2 | OD260/280 = 1,7-2,5 OD260/230 = 0,5-2,5 Takmarkað eða ekkert prótein eða DNA mengun sýnd á hlaupi. | Fyrir plöntur: rin≥4,0; Fyrir dýr: rin≥4,5; 5,0 ≥28s/18s ≥1,0; Takmörkuð eða engin upphæð grunnlínu |
● Plöntur:
Rót, stilkur eða petal: 450 mg
Lauf eða fræ: 300 mg
Ávöxtur: 1,2 g
● Dýr:
Hjarta eða þörmum: 300 mg
Viscera eða heila: 240 mg
Vöðvi: 450 mg
Bein, hár eða húð: 1G
● liðdýr:
Skordýr: 6g
Crustacea: 300 mg
● Heilblóð: 1 rör
● Frumur: 106 frumur
Mælt með afhendingu sýnisins
Gámur: 2 ml skilvindu rör (ekki er mælt með tini filmu)
Dæmi um merkingu: Hópur+endurtaka EG A1, A2, A3; B1, B2, B3.
Sending:
1. Dry-Iice: Sýnishorn þarf að pakka í töskur og grafin í þurru.
2. RNASTABLE rör: RNA sýni er hægt að þurrka í RNA stöðugleika rör (td RNAntable®) og send í stofuhita.
Þjónustuvinnuflæði
Tilraunahönnun
Sýnishorn
RNA útdráttur
Bókasafnsbygging
Raðgreining
Gagnagreining
Eftir sölu þjónustu
Bioinformatics
Transcriptome samsetning og val á unigene
Unigene athugasemd
Sýnishorn fylgni og mat á líffræðilegum endurtekningum
Gen (Degs) á mismunandi hátt
Hagnýtur umsögn Degs
Virk auðgun Degs
Kannaðu framfarir sem auðveldar af heilkjörnungum BMKGENES NGS mRNA raðgreiningarþjónustu í gegnum safnað safn af ritum.
Shen, F. o.fl. (2020) 'De novo trancriptome samsetning og kynjaða genatjáning í kynkirtlum Amur steinbíts (Silurus Asotus)', Genomics, 112 (3), bls. 2603–2614. doi: 10.1016/j.ygeno.2020.01.026.
Zhang, C. o.fl. (2016) 'Transcriptome greining á súkrósaumbrotum við bólgu og þroska peru í lauk (Allium Cepa L.)', Frontiers in Plant Science, 7 (september), bls. 212763. DOI: 10.3389/fpls.2016.01425/bibtex.
Zhu, C. o.fl. (2017) 'De Novo þing, persónusköpun og athugasemd fyrir afrit af Sarcocheilichthys sinensis', PLoS One, 12 (2). doi: 10.1371/journal.pone.0171966.
Zou, L. o.fl. (2021) 'De Novo Transcriptome greining veitir innsýn í saltþol podocarpus macrophyllus undir seltuálagi', BMC plöntulíffræði, 21 (1), bls. 1–17. doi: 10.1186/S12870-021-03274-1/FYRIRTÆKI/9.
