mRNA-seq (ngs) með viðmiðunargenamengi
RNA-seq er venjulegt tæki í lífinu og ræktunarvísindum og brúar bilið milli genamengi og próteóma. Styrkur þess liggur í því að uppgötva ný afrit og mæla tjáningu þeirra í einni prófun. Það er mikið notað til samanburðarrannsókna, sem varpa ljósi á gen sem tengjast ýmsum eiginleikum eða svipgerðum, eins og að bera saman stökkbrigði við villigerð eða afhjúpa genatjáningu við sérstakar aðstæður. BMKCLOUD mRNA (tilvísun) App samþættir tjáningargreining, mismunadjáningargreiningu (DEG) og röð uppbyggingar greiningar í mRNA-seq (NGS) lífupplýsingaleiðsluna og sameinar styrkleika svipaðs hugbúnaðar, sem tryggir þægindi og notendavænni. Notendur geta hlaðið RNA-seq gögnum sínum í skýið þar sem appið býður upp á alhliða, einn-stöðvaða lífupplýsingagreiningarlausn. Að auki forgangsraðar það upplifun viðskiptavina og býður upp á persónulega rekstur sem er sérsniðinn að sérstökum þörfum notenda. Notendur geta stillt færibreytur og sent leiðsluleiðangurinn út af fyrir sig, skoðað gagnvirka skýrsluna, skoðað gögn/skýringarmyndir og lokið gagnavinnslu, svo sem: Val á geni, virkni þyrping, myndgreining osfrv.
Pallur:Illumina, MGI
Stefna:RNA-seq
Skipulag: Samsett, hreina gögn.
Tegund bókasafna:fr-unstranded, fr-firststrand eða fr-secondstrand
Lestu lengd:150 bp
Skráartegund:*.fastq, *.fq, *.fastq.gz eða *.fq.gz. Kerfið munParaðu sjálfkrafa .fastq skrárnar í samræmi við skráarheiti,td *_1.fastq parað við *._ 2.fastq.
Fjöldi sýna:Engar takmarkanir eru á tölunnisýna, en greiningartíminn mun aukast eftir því sem fjöldisýni vex.
Mælt með upphæð gagna:6g á sýni