● Röðun á Illumina NovaSeq með PE150.
● Þjónustan krefst þess að vefjasýni, í stað útdregna kjarnsýra, krosstengjast formaldehýði og varðveita milliverkanir DNA og próteina.
● Hi-C tilraunin felur í sér takmörkun og endaviðgerð á klístruðum endum með bíótíni, fylgt eftir með hringrás á bitlausu endum sem myndast á meðan víxlverkunin varðveitist. DNAið er síðan dregið niður með streptavidínkúlum og hreinsað til síðari undirbúnings safns.
●Optimal Restriction Enzyme Design: til að tryggja mikla Hi-C skilvirkni á mismunandi tegundum með allt að 93% gildum víxlverkunarpörum.
●Víðtæk sérfræðiþekking og útgáfuskrár:BMKGene hefur mikla reynslu af >2000 Hi-C raðgreiningarverkefnum frá 800 mismunandi tegundum og ýmsum einkaleyfum. Yfir 100 birt tilvik með uppsafnaðan áhrifaþátt upp á yfir 900.
●Mjög hæft lífupplýsingateymi:með eigin einkaleyfi og höfundarrétti hugbúnaðar fyrir Hi-C tilraunir og gagnagreiningu og sjálfþróaðan sjónræn gagnahugbúnað.
●Stuðningur eftir sölu:Skuldbinding okkar nær út fyrir verklok með 3ja mánaða þjónustutíma eftir sölu. Á þessum tíma bjóðum við upp á verkefni eftirfylgni, aðstoð við bilanaleit og spurningar og svör til að svara öllum fyrirspurnum sem tengjast niðurstöðunum.
●Alhliða skýring: við notum marga gagnagrunna til að skýra genin með skilgreindum afbrigðum og framkvæma samsvarandi auðgunargreiningu og veita innsýn í mörg rannsóknarverkefni.
Bókasafn | Röðunaráætlun | Mælt er með gagnaúttak | Hi-C merkjaupplausn |
Hi-C bókasafn | Illumina PE150 | Chromatin lykkja: 150x TAD: 50x | Chromatin Loop: 10Kb TAD: 40Kb |
Tegund sýnis | Áskilið magn |
Dýravefur | ≥2g |
Heilt blóð | ≥2ml |
Sveppir | ≥1g |
Plöntu- ungur vefur | 1g/deilur, 2-4 skammtar mælt með |
Ræktaðar frumur | ≥1x107 |
Inniheldur eftirfarandi greining:
● Hrá gögn QC;
● Kortlagning og Hi-C bókasafn QC: gild víxlverkunarpör og Interaction Decay Exponents (IDEs);
● Erfðamengi-wide Interaction Profiling: cis/trans greining og Hi-C samspil kort;
● Greining á dreifingu A/B hólfa;
● Auðkenning TADs og krómatínlykkju;
● Mismunagreining á þrívíddarþáttum litningabyggingar meðal sýna og samsvarandi virkniskýring á tengdum genum.
Cis og trans hlutfallsdreifing
Hitakort af víxlverkun litninga milli sýna
Dreifing A/B hólfa um allt erfðamengi
Erfðamengi-breið dreifing chromatin loops
Sýning á TAD
Kannaðu rannsóknarframfarirnar sem Hi-C raðgreiningarþjónusta BMKGene auðveldar í gegnum safn rita.
Meng, T. o.fl. (2021) „Sameiginleg samþætt fjöl-omics greining auðkennir CA2 sem nýtt markmið fyrir chordoma“,Taugakrabbameinslækningar, 23(10), bls. 1709–1722. doi: 10.1093/NEUONC/NOAB156.
Xu, L. o.fl. (2021) „3D óskipulag og endurröðun erfðamengis veitir innsýn í meingerð NAFLD með samþættri Hi-C, Nanopore og RNA raðgreiningu“,Acta Pharmaceutica Sinica B, 11(10), bls. 3150–3164. doi: 10.1016/J.APSB.2021.03.022.