Exclusive Agency for Korea

条形 banner-03

Vörur

Hi-C byggt Chromatin Interaction

Hi-C er aðferð sem er hönnuð til að fanga erfðafræðilega uppsetningu með því að sameina rannsakandi nálægðarsamskipti og raðgreiningu með mikilli afköstum. Aðferðin byggir á krómatín-krosstengingu við formaldehýð, síðan er melting og endurbinding á þann hátt að einungis brot sem eru samgild tengd mynda bindingarafurðir. Með því að raða þessum bindingarafurðum er hægt að rannsaka þrívíddarskipulag erfðamengisins. Hi-C gerir kleift að rannsaka dreifingu þeirra hluta erfðamengisins sem eru léttpakkaðir (A hólf, euchromatin) og líklegri til að vera umritunarvirkt, og svæða sem eru þéttari (B hólf, Heterochromatin). Hi-C er einnig hægt að nota til að ákvarða Topologically Associated Domains (TADs), svæði í erfðamenginu sem hafa brotna uppbyggingu og eru líkleg til að hafa svipað tjáningarmynstur, og til að bera kennsl á litningalykkjur, DNA svæði sem eru fest saman af próteinum og sem eru oft auðgað í reglugerðarþáttum. Hi-C raðgreiningarþjónusta BMKGene gerir vísindamönnum kleift að kanna staðbundnar víddir erfðafræðinnar, opna nýjar leiðir til að skilja erfðamengisstjórnun og áhrif þess á heilsu og sjúkdóma.


Upplýsingar um þjónustu

Lífupplýsingafræði

Niðurstöður kynningar

Valin rit

Þjónustueiginleikar

● Röðun á Illumina NovaSeq með PE150.

● Þjónustan krefst þess að vefjasýni, í stað útdregna kjarnsýra, krosstengjast formaldehýði og varðveita milliverkanir DNA og próteina.

● Hi-C tilraunin felur í sér takmörkun og endaviðgerð á klístruðum endum með bíótíni, fylgt eftir með hringrás á bitlausu endum sem myndast á meðan víxlverkunin varðveitist. DNAið er síðan dregið niður með streptavidínkúlum og hreinsað til síðari undirbúnings safns.

Þjónustukostir

Optimal Restriction Enzyme Design: til að tryggja mikla Hi-C skilvirkni á mismunandi tegundum með allt að 93% gildum víxlverkunarpörum.

Víðtæk sérfræðiþekking og útgáfuskrár:BMKGene hefur mikla reynslu af >2000 Hi-C raðgreiningarverkefnum frá 800 mismunandi tegundum og ýmsum einkaleyfum. Yfir 100 birt tilvik með uppsafnaðan áhrifaþátt upp á yfir 900.

Mjög hæft lífupplýsingateymi:með eigin einkaleyfi og höfundarrétti hugbúnaðar fyrir Hi-C tilraunir og gagnagreiningu og sjálfþróaðan sjónræn gagnahugbúnað.

Stuðningur eftir sölu:Skuldbinding okkar nær út fyrir verklok með 3ja mánaða þjónustutíma eftir sölu. Á þessum tíma bjóðum við upp á verkefni eftirfylgni, aðstoð við bilanaleit og spurningar og svör til að svara öllum fyrirspurnum sem tengjast niðurstöðunum.

Alhliða skýring: við notum marga gagnagrunna til að skýra genin með skilgreindum afbrigðum og framkvæma samsvarandi auðgunargreiningu og veita innsýn í mörg rannsóknarverkefni.

Þjónustulýsingar

Bókasafn

Röðunaráætlun

Mælt er með gagnaúttak

Hi-C merkjaupplausn

Hi-C bókasafn

Illumina PE150

Chromatin lykkja: 150x

TAD: 50x

Chromatin Loop: 10Kb

TAD: 40Kb

Þjónustukröfur

Tegund sýnis

Áskilið magn

Dýravefur

≥2g

Heilt blóð

≥2ml

Sveppir

≥1g

Plöntu- ungur vefur

1g/deilur, 2-4 skammtar mælt með

Ræktaðar frumur

≥1x107


  • Fyrri:
  • Næst:

  • 图片98

    Inniheldur eftirfarandi greining:

    ● Hrá gögn QC;

    ● Kortlagning og Hi-C bókasafn QC: gild víxlverkunarpör og Interaction Decay Exponents (IDEs);

    ● Erfðamengi-wide Interaction Profiling: cis/trans greining og Hi-C samspil kort;

    ● Greining á dreifingu A/B hólfa;

    ● Auðkenning TADs og krómatínlykkju;

    ● Mismunagreining á þrívíddarþáttum litningabyggingar meðal sýna og samsvarandi virkniskýring á tengdum genum.

    Cis og trans hlutfallsdreifing

    mynd 99

     

    Hitakort af víxlverkun litninga milli sýna

    mynd 100

     

    Dreifing A/B hólfa um allt erfðamengimynd 23

     

    Erfðamengi-breið dreifing chromatin loops

     

    mynd 102

     

    Sýning á TAD

    mynd 103

     

    Kannaðu rannsóknarframfarirnar sem Hi-C raðgreiningarþjónusta BMKGene auðveldar í gegnum safn rita.

     

     

    Meng, T. o.fl. (2021) „Sameiginleg samþætt fjöl-omics greining auðkennir CA2 sem nýtt markmið fyrir chordoma“,Taugakrabbameinslækningar, 23(10), bls. 1709–1722. doi: 10.1093/NEUONC/NOAB156.

    Xu, L. o.fl. (2021) „3D óskipulag og endurröðun erfðamengis veitir innsýn í meingerð NAFLD með samþættri Hi-C, Nanopore og RNA raðgreiningu“,Acta Pharmaceutica Sinica B, 11(10), bls. 3150–3164. doi: 10.1016/J.APSB.2021.03.022.

    fáðu tilboð

    Skrifaðu skilaboðin þín hér og sendu okkur

    Sendu skilaboðin þín til okkar: