Exclusive Agency for Korea

Vörur

Sambandsgreining á erfðamengi

Erfðamengi-wide Association Analysis Valin mynd

Markmið Genome-Wide Association Studies (GWAS) er að bera kennsl á erfðaafbrigði (arfgerðir) sem tengjast sérstökum eiginleikum (svipgerðum). Með því að rýna í erfðamerki yfir allt erfðamengið hjá fjölda einstaklinga framreikna GWAS tengsl arfgerðar-svipgerðar með tölfræðilegum greiningum á íbúastigi. Þessi aðferðafræði nýtur víðtækrar notkunar við rannsóknir á sjúkdómum í mönnum og kanna starfræn gen sem tengjast flóknum eiginleikum í dýrum eða plöntum.

Hjá BMKGENE bjóðum við upp á tvær leiðir til að framkvæma GWAS á stórum þýðum: að nota Whole-Genome Sequencing (WGS) eða velja minni framsetningu erfðamengisraðgreiningaraðferðar, hina eigin þróaða Specific-Locus Amplified Fragment (SLAF). Þó að WGS henti smærri erfðamengi, kemur SLAF fram sem hagkvæmur valkostur til að rannsaka stærri íbúa með lengri erfðamengi, sem lágmarkar í raun raðgreiningarkostnað, á sama tíma og tryggir mikla erfðafræðilega uppgötvun skilvirkni.

Hafðu samband

Upplýsingar um þjónustu

Lífupplýsingafræði

Niðurstaða kynningar

Valin rit

Verkflæði

Þjónustukostir

●Víðtæk sérfræðiþekking og útgáfuskrár: með uppsafnaðri reynslu í GWAS hefur BMKGene lokið hundruðum tegundaverkefna í rannsóknum á stofn GWAS, aðstoðað vísindamenn við að birta meira en 100 greinar og uppsafnaður áhrifaþáttur náði 500.

● Alhliða lífupplýsingagreining: verkflæði felur í sér SNP-eiginleika tengslagreiningu, sem skilar mengi umsækjenda gena og samsvarandi virkniskýringu þeirra.

●Mjög hæft lífupplýsingateymi og stutt greiningarlota: með mikla reynslu í háþróaðri erfðafræðigreiningu, skilar teymi BMKGene alhliða greiningar með skjótum afgreiðslutíma.

●Stuðningur eftir sölu:Skuldbinding okkar nær út fyrir verklok með 3ja mánaða þjónustutíma eftir sölu. Á þessum tíma bjóðum við upp á verkefni eftirfylgni, aðstoð við bilanaleit og spurningar og svör til að svara öllum fyrirspurnum sem tengjast niðurstöðunum.

Þjónustuforskriftir og kröfur

Tegund raðgreiningar

Ráðlagður íbúakvarði

Röðunarstefna

Núkleótíðþörf

Röð alls genamengis

200 sýnishorn

10x

Styrkur: ≥ 1 ng/ µL

Heildarupphæð ≥ 30ng

Takmarkað eða engin niðurbrot eða mengun

Specific-Locus Amplified Fragment (SLAF)

Merki dýpt: 10x

Fjöldi merkja:

< 400 Mb: Mælt er með WGS

< 1Gb: 100K merki

1Gb

> 2Gb: 300K merki

Hámark 500 þúsund merki

Styrkur ≥ 5 ng/µL

Heildarmagn ≥ 80 ng

Nanodrop OD260/280=1,6-2,5

Agarósa hlaup: ekkert eða takmarkað niðurbrot eða mengun

Efnisval

Mismunandi afbrigði, undirtegundir, landkyn/erfðabankar/blandaðar fjölskyldur/villtar auðlindir

Mismunandi afbrigði, undirtegundir, landkyn

Hálfsystkinafjölskylda/alsystkinafjölskylda/villtar auðlindir

Þjónustuverkflæði

Hönnun tilrauna

Sýnishorn afhending

RNA útdráttur

Bókasafnsbygging

Röðun

Gagnagreining

Þjónusta eftir sölu

Fyrri: Einkjarna RNA röðun

Næst: PacBio 2+3 mRNA lausn í fullri lengd

Inniheldur eftirfarandi greiningu:

Sambandsgreining á erfðamengi: LM, LMM, EMMAX, FASTLMM líkan
Hagnýtur skýring á kandidatgenum

SNP-eiginleikatengslagreining – Manhattan söguþráður

SNP-eiginleikatengslagreining – QQ plot

Skoðaðu framfarirnar sem BMKGene's de GWAS þjónustur auðveldar í gegnum safn rita:

Lv, L. o.fl. (2023) „Innsýn í erfðafræðilegan grundvöll ammoníakþols í rakhnífasamloku Sinonovacula constricta með rannsókn á erfðamengi-vítt samband“,Fiskeldi, 569, bls. 739351. doi: 10.1016/J.AQUACULTURE.2023.739351.

Li, X. o.fl. (2022) „Margómagreiningar á 398 aðildum refahalahirsi leiða í ljós erfðafræðileg svæði sem tengjast tæmingu, eiginleikum umbrotsefna og bólgueyðandi áhrifum“,Sameindaplanta, 15(8), bls. 1367–1383. doi: 10.1016/j.molp.2022.07.003.

Li, J. o.fl. (2022) 'Genome-Wide Association Kortlagning á Hulless Barely Phenotypes in Drought Environment',Landamæri í plöntuvísindum, 13, bls. 924892. doi: 10.3389/FPLS.2022.924892/BIBTEX.

Zhao, X. o.fl. (2021) „GmST1, sem kóðar súlfótransferasa, veitir þol gegn sojabaunamósaíkveirustofnum G2 og G3“,Plöntu, fruma og umhverfi, 44(8), bls. 2777–2792. doi: 10.1111/PCE.14066.