● Handtaka á pólý-A mRNA fylgt eftir með myndun cDNA og undirbúningur safns
● Röð afrita í fullri lengd
● Lífupplýsingagreining byggð á samstillingu við viðmiðunarerfðamengi
● Lífupplýsingagreining felur ekki aðeins í sér tjáningu á gena- og ísóformastigi heldur einnig greiningu á lncRNA, genasamruna, fjöl-adenýleringu og genabyggingu
●Magngreining tjáningar á ísóformastigi: gerir ítarlega og nákvæma tjáningargreiningu kleift, afhjúpar breytingu sem gæti verið dulbúin þegar öll genatjáningin er greind
●Minni gagnakröfur:Í samanburði við Next-Generation Sequencing (NGS), sýnir Nanopore raðgreining lægri gagnakröfur, sem gerir kleift að jafngilda magnmettun genatjáningar með smærri gögnum.
●Meiri nákvæmni tjáningarmælingar: bæði á gena- og ísóformum stigi
●Auðkenning viðbótarupplýsingaupplýsinga: önnur pólýadenýlering, samrunargen og lcnRNA og markgen þeirra
●Víðtæk sérfræðiþekking: Teymið okkar kemur með mikla reynslu í hvert verkefni, hefur lokið yfir 850 Nanopore fullri lengd umritunarverkefnum og unnið yfir 8.000 sýni.
●Stuðningur eftir sölu: Skuldbinding okkar nær út fyrir verklok með 3ja mánaða þjónustutíma eftir sölu. Á þessum tíma bjóðum við upp á verkefni eftirfylgni, aðstoð við bilanaleit og spurningar og svör til að svara öllum fyrirspurnum sem tengjast niðurstöðunum.
Bókasafn | Röðunarstefna | Mælt er með gögnum | Gæðaeftirlit |
Poly A auðgað | Illumina PE150 | 6/12 Gb | Meðalgæðaeinkunn: Q10 |
Styrkur (ng/μl) | Magn (μg) | Hreinleiki | Heiðarleiki |
≥ 100 | ≥ 1,0 | OD260/280=1,7-2,5 OD260/230=0,5-2,5 Takmörkuð eða engin prótein- eða DNA mengun sýnd á hlaupi. | Fyrir plöntur: RIN≥7,0; Fyrir dýr: RIN≥7,5; 5,0≥28S/18S≥1,0; takmörkuð eða engin grunnhækkun |
● Plöntur:
Rót, stilkur eða krónublað: 450 mg
Blað eða fræ: 300 mg
Ávextir: 1,2 g
● Dýr:
Hjarta eða þörmum: 300 mg
Innyfli eða heili: 240 mg
Vöðvar: 450 mg
Bein, hár eða húð: 1g
● Liðdýr:
Skordýr: 6g
Krabbadýr: 300 mg
● Heilblóð: 1 rör
● Frumur: 106 frumur
Ílát: 2 ml miðflóttahólkur (tini er ekki mælt með)
Merking sýnis: Hópur+afrit td A1, A2, A3; B1, B2, B3.
Sending:
1. Þurrís: Pakka þarf sýnum í poka og grafa í þurrís.
2. RNA-stöðug rör: Hægt er að þurrka RNA-sýni í RNA-stöðugleikaglasi (td RNAstable®) og senda við stofuhita.
● Hrágagnavinnsla
● Auðkenning afrits
● Önnur splicing
● Tjáningarmagngreining í genastigi og ísóformastigi
● Mismunatjáningargreining
● Aðgerðarskýringar og auðgun (DEG og DET)
Önnur splicing greining Önnur pólýadenýlerunargreining (APA)
lncRNA spá
Skýring á nýjum genum
Þyrping DETs
Prótein-prótein net í DEG
Kannaðu framfarirnar sem BMKGene's Nanopore mRNA raðgreiningarþjónustu í fullri lengd auðveldar í gegnum safn rita.
Gong, B. o.fl. (2023) 'Epigenetic og umritunarvirkjun seytingarkínasa FAM20C sem krabbameinsgena í glioma', Journal of Genetics and Genomics, 50(6), bls. 422–433. doi: 10.1016/J.JGG.2023.01.008.
Hann, Z. o.fl. (2023) „Umskriftarröð eitilfrumna í fullri lengd bregðast við IFN-γ sýnir Th1-skekkt ónæmissvörun í flundru (Paralichthys olivaceus)“, Fish & Shellfish Immunology, 134, bls. 108636. doi: 10.1016/J.FSI.2023.108636.
Ma, Y. o.fl. (2023) „Samanburðargreining á PacBio og ONT RNA raðgreiningaraðferðum fyrir Nemopilema Nomurai eiturgreining“, Genomics, 115(6), bls. 110709. doi: 10.1016/J.YGENO.2023.110709.
Yu, D. o.fl. (2023) „Nano-seq greining leiðir í ljós mismunandi starfræna tilhneigingu milli exosomas og microvesicles unnin úr hUMSC“, Stofnfrumurannsóknir og meðferð, 14(1), bls. 1–13. doi: 10.1186/S13287-023-03491-5/TAFLAR/6.