Exclusive Agency for Korea

条形 banner-03

Vörur

Full-lengd mRNA Sequencing-Nanopore

Þó að NGS-undirstaða mRNA raðgreining sé fjölhæft tæki til að mæla tjáningu gena, þá takmarkar það að treysta á stutta lestur virkni þess í flóknum umritunargreiningum. Á hinn bóginn notar nanopore raðgreiningu langlestra tækni, sem gerir raðgreiningu mRNA afrita í fullri lengd kleift. Þessi nálgun auðveldar yfirgripsmikla könnun á öðrum skeytingum, genasamruna, fjöl-adenýleringu og magngreiningu mRNA ísóforma.

Nanopore raðgreining, aðferð sem byggir á nanopore einnar sameind í rauntíma rafmerkjum, gefur niðurstöður í rauntíma. Með hreyfipróteinum að leiðarljósi binst tvíþátta DNA við nanopore prótein sem eru felld inn í líffilmu, vinda ofan af því þegar það fer í gegnum nanopore rásina undir spennumun. Sérstök rafboð sem myndast af mismunandi basum á DNA strengnum eru greind og flokkuð í rauntíma, sem auðveldar nákvæma og samfellda núkleótíðaröð. Þessi nýstárlega nálgun yfirstígur takmarkanir á stuttum lestri og veitir kraftmikinn vettvang fyrir flókna erfðafræðilega greiningu, þar á meðal flóknar umritunarrannsóknir, með tafarlausum árangri.

Pall: Nanopore PromethION 48


Upplýsingar um þjónustu

Lífupplýsingafræði

Niðurstöður kynningar

Valin rit

Eiginleikar

● Handtaka á pólý-A mRNA fylgt eftir með myndun cDNA og undirbúningur safns

● Röð afrita í fullri lengd

● Lífupplýsingagreining byggð á samstillingu við viðmiðunarerfðamengi

● Lífupplýsingagreining felur ekki aðeins í sér tjáningu á gena- og ísóformastigi heldur einnig greiningu á lncRNA, genasamruna, fjöl-adenýleringu og genabyggingu

Þjónustukostir

Magngreining tjáningar á ísóformastigi: gerir ítarlega og nákvæma tjáningargreiningu kleift, afhjúpar breytingu sem gæti verið dulbúin þegar öll genatjáningin er greind

Minni gagnakröfur:Í samanburði við Next-Generation Sequencing (NGS), sýnir Nanopore raðgreining lægri gagnakröfur, sem gerir kleift að jafngilda magnmettun genatjáningar með smærri gögnum.

Meiri nákvæmni tjáningarmælingar: bæði á gena- og ísóformum stigi

Auðkenning viðbótarupplýsingaupplýsinga: önnur pólýadenýlering, samrunargen og lcnRNA og markgen þeirra

Víðtæk sérfræðiþekking: Teymið okkar kemur með mikla reynslu í hvert verkefni, hefur lokið yfir 850 Nanopore fullri lengd umritunarverkefnum og unnið yfir 8.000 sýni.

Stuðningur eftir sölu: Skuldbinding okkar nær út fyrir verklok með 3ja mánaða þjónustutíma eftir sölu. Á þessum tíma bjóðum við upp á verkefni eftirfylgni, aðstoð við bilanaleit og spurningar og svör til að svara öllum fyrirspurnum sem tengjast niðurstöðunum.

Dæmi um kröfur og afhending

Bókasafn

Röðunarstefna

Mælt er með gögnum

Gæðaeftirlit

Poly A auðgað

Illumina PE150

6/12 Gb

Meðalgæðaeinkunn: Q10

Dæmi um kröfur:

Núkleótíð:

Styrkur (ng/μl)

Magn (μg)

Hreinleiki

Heiðarleiki

≥ 100

≥ 1,0

OD260/280=1,7-2,5

OD260/230=0,5-2,5

Takmörkuð eða engin prótein- eða DNA mengun sýnd á hlaupi.

Fyrir plöntur: RIN≥7,0;

Fyrir dýr: RIN≥7,5;

5,0≥28S/18S≥1,0;

takmörkuð eða engin grunnhækkun

● Plöntur:

Rót, stilkur eða krónublað: 450 mg

Blað eða fræ: 300 mg

Ávextir: 1,2 g

● Dýr:

Hjarta eða þörmum: 300 mg

Innyfli eða heili: 240 mg

Vöðvar: 450 mg

Bein, hár eða húð: 1g

● Liðdýr:

Skordýr: 6g

Krabbadýr: 300 mg

● Heilblóð: 1 rör

● Frumur: 106 frumur

Mælt er með sýnishornafhendingu

Ílát: 2 ml miðflóttahólkur (tini er ekki mælt með)

Merking sýnis: Hópur+afrit td A1, A2, A3; B1, B2, B3.

Sending:

1. Þurrís: Pakka þarf sýnum í poka og grafa í þurrís.

2. RNA-stöðug rör: Hægt er að þurrka RNA-sýni í RNA-stöðugleikaglasi (td RNAstable®) og senda við stofuhita.

Þjónustuverkflæði

Núkleótíð:

sýnishorn afhending

Sýnishorn afhending

Undirbúningur bókasafns

Bókasafnsbygging

Röðun

Röðun

Gagnagreining

Gagnagreining

Þjónusta eftir sölu

Þjónusta eftir sölu

Þjónustuverkflæði

Vefur:

Dæmi um QC

Hönnun tilrauna

sýnishorn afhending

Sýnishorn afhending

Tilraunatilraun

RNA útdráttur

Undirbúningur bókasafns

Bókasafnsbygging

Röðun

Röðun

Gagnagreining

Gagnagreining

Þjónusta eftir sölu

Þjónusta eftir sölu


  • Fyrri:
  • Næst:

  • í fullri lengd

    ● Hrágagnavinnsla

    ● Auðkenning afrits

    ● Önnur splicing

    ● Tjáningarmagngreining í genastigi og ísóformastigi

    ● Mismunatjáningargreining

    ● Aðgerðarskýringar og auðgun (DEG og DET)

     

    Önnur splicing greiningmynd 20 Önnur pólýadenýlerunargreining (APA)

     

    mynd 21

     

    lncRNA spá

     mynd 22

     

    Skýring á nýjum genum

     mynd 23

     

     

     Þyrping DETs

     

     mynd 24

     

     

    Prótein-prótein net í DEG

     

      mynd 25 

    Kannaðu framfarirnar sem BMKGene's Nanopore mRNA raðgreiningarþjónustu í fullri lengd auðveldar í gegnum safn rita.

     

    Gong, B. o.fl. (2023) 'Epigenetic og umritunarvirkjun seytingarkínasa FAM20C sem krabbameinsgena í glioma', Journal of Genetics and Genomics, 50(6), bls. 422–433. doi: 10.1016/J.JGG.2023.01.008.

    Hann, Z. o.fl. (2023) „Umskriftarröð eitilfrumna í fullri lengd bregðast við IFN-γ sýnir Th1-skekkt ónæmissvörun í flundru (Paralichthys olivaceus)“, Fish & Shellfish Immunology, 134, bls. 108636. doi: 10.1016/J.FSI.2023.108636.

    Ma, Y. o.fl. (2023) „Samanburðargreining á PacBio og ONT RNA raðgreiningaraðferðum fyrir Nemopilema Nomurai eiturgreining“, Genomics, 115(6), bls. 110709. doi: 10.1016/J.YGENO.2023.110709.

    Yu, D. o.fl. (2023) „Nano-seq greining leiðir í ljós mismunandi starfræna tilhneigingu milli exosomas og microvesicles unnin úr hUMSC“, Stofnfrumurannsóknir og meðferð, 14(1), bls. 1–13. doi: 10.1186/S13287-023-03491-5/TAFLAR/6.

     

    fáðu tilboð

    Skrifaðu skilaboðin þín hér og sendu okkur

    Sendu skilaboðin þín til okkar: