●Pallar:Illumina NovaSeq 6000 og NovaSeq X Plus
●Röðunarstillingar:PE150 og PE250
●Gæðaeftirlit með bókasöfnum fyrir röðun
●Röð gagna QC og afhending:afhending QC skýrslu og hrágagna á fastq sniði eftir afmultiplexing og síun Q30 lestur
●Fjölhæfni raðgreiningarþjónustu:viðskiptavinurinn getur valið að raða eftir akrein, flæðihólfi eða eftir gagnamagni sem krafist er (röðun að hluta).
●Víðtæk reynsla á Illumina raðkerfisvettvangi:með þúsundum lokaðra verkefna með ýmsar tegundir.
●Afhending raðgreiningar QC skýrslu:með gæðamælingum, nákvæmni gagna og heildarframmistöðu raðgreiningarverkefnisins.
●Þroskað raðunarferli:með stuttum afgreiðslutíma.
●Strangt gæðaeftirlit: Við innleiðum strangar QC kröfur til að tryggja afhendingu stöðugt hágæða niðurstöður.
Pallur | Flæðisfrumur | Röðunarhamur | Eining | Áætluð framleiðsla |
NovaSeq X | 10B (8 brautir) | PE150 | Einbreið braut Akrein að hluta | 375Gb / akrein |
25B (8 brautir) | PE150 | Einbreið braut Akrein að hluta | 1000 Gb/akrein | |
NovaSeq 6000 | SP Flow klefi (2 brautir) | PE250 | Flæðisfrumur Einbreið braut Akrein að hluta | 325-400 M lestur / Akrein |
S4 flæðisfrumur (4 brautir) | PE150 | Flæðisfrumur Einbreið braut Akrein að hluta | ~800 Gb / akrein |
Gagnamagn (X) | Styrkur (qPCR/nM) | Bindi | |
Akreinaröð að hluta
| X ≤ 10 Gb | ≥ 1 nM | ≥ 25 μl |
10 Gb < X ≤ 50 Gb | ≥ 2 nM | ≥ 25 μl | |
50 Gb < X ≤ 100 Gb | ≥ 3 nM | ≥ 25 μl | |
X > 100 Gb | ≥ 4 nM | ≥ 25 μl | |
Akreinaröðun | Per Lane | ≥ 1,5 nM / Bókasafnslaug | ≥ 25 μl / Bókasafnslaug |
Auk styrks og heildarmagns er einnig krafist viðeigandi toppmynsturs.
Athugið: Akreinaröðun bókasöfna með litlum fjölbreytileika krefst PhiX spike-in til að tryggja öflugt grunnsímtal.
Við mælum með því að senda inn fyrirfram sameinuð bókasöfn sem sýnishorn. Ef þú krefst þess að BMKGENE framkvæmi samsöfnun bókasafna, vinsamlegast vísaðu til
kröfur bókasafnsins um röðun akreina að hluta.
Aðaltoppurinn ætti að vera innan við 300-450 bp.
Bókasöfn ættu að hafa einn aðaltopp, enga millistykkismengun og enga primer dimera.
Skýrsla um gæði safnsins er gefin fyrir raðgreiningu, mat á magni safns og sundrun.
Tafla 1. Tölfræði um raðgreiningargögn.
Sýnishorn | BMKID | Hrá les | Óunnin gögn (bp) | Hrein lesning (%) | Q20(%) | Q30(%) | GC(%) |
C_01 | BMK_01 | 22.870.120 | 6.861.036.000 | 96,48 | 99,14 | 94,85 | 36,67 |
C_02 | BMK_02 | 14.717.867 | 4.415.360.100 | 96,00 | 98,95 | 93,89 | 37.08 |
Mynd 1. Gæðadreifing eftir lestri í hverju sýni
Mynd 2. Grunnefnisdreifing
Mynd 3. Dreifing lesins efnis í raðgreiningargögnum