Exclusive Agency for Korea

条形 banner-03

Vörur

Illumina forsmíðuð bókasöfn

Illumina raðgreiningartækni, sem byggir á Sequencing by Synthesis (SBS), er NGS nýsköpun sem hefur verið tekin fyrir á heimsvísu, sem ber ábyrgð á að búa til yfir 90% af raðgreiningargögnum heimsins. Meginreglan um SBS felur í sér að mynda flúrljómandi merkta afturkræfa terminators þar sem hverju dNTP er bætt við og síðan klofið til að leyfa innlimun næsta basa. Þar sem öll fjögur afturkræf terminator-bundin dNTP eru til staðar í hverri röðunarlotu, lágmarkar náttúruleg samkeppni innlimunarskekkju. Þessi fjölhæfa tækni styður bæði einlesin og pöruð bókasöfn, sem hentar ýmsum erfðafræðilegum forritum. Hátt afköst og nákvæmni Illumina raðgreiningar staðsetja hana sem hornstein í erfðafræðirannsóknum, sem gerir vísindamönnum kleift að afhjúpa ranghala erfðamengis með óviðjafnanlegum smáatriðum og skilvirkni.

Forsmíðaða bókasafnsraðgreiningarþjónustan okkar gerir viðskiptavinum kleift að útbúa raðgreiningarsöfn frá ýmsum aðilum (mRNA, heilt erfðamengi, amplicon, 10x bókasöfn, meðal annarra). Í kjölfarið er hægt að senda þessi bókasöfn til raðgreiningarmiðstöðva okkar fyrir gæðaeftirlit og raðgreiningu á Illumina kerfum.


Upplýsingar um þjónustu

Niðurstaða kynningar

Eiginleikar

Pallar:Illumina NovaSeq 6000 og NovaSeq X Plus

Röðunarstillingar:PE150 og PE250

Gæðaeftirlit með bókasöfnum fyrir röðun

Röð gagna QC og afhending:afhending QC skýrslu og hrágagna á fastq sniði eftir afmultiplexing og síun Q30 lestur

 

 

Þjónustukostir

Fjölhæfni raðgreiningarþjónustu:viðskiptavinurinn getur valið að raða eftir akrein, flæðihólfi eða eftir gagnamagni sem krafist er (röðun að hluta).

Víðtæk reynsla á Illumina raðkerfisvettvangi:með þúsundum lokaðra verkefna með ýmsar tegundir. 

Afhending raðgreiningar QC skýrslu:með gæðamælingum, nákvæmni gagna og heildarframmistöðu raðgreiningarverkefnisins.

Þroskað raðunarferli:með stuttum afgreiðslutíma.

Strangt gæðaeftirlit: Við innleiðum strangar QC kröfur til að tryggja afhendingu stöðugt hágæða niðurstöður.

 

 

Dæmi um palla

Pallur

Flæðisfrumur

Röðunarhamur

Eining

Áætluð framleiðsla

NovaSeq X

10B (8 brautir)

PE150

Einbreið braut

Akrein að hluta

375Gb / akrein

25B (8 brautir)

PE150

Einbreið braut

Akrein að hluta

1000 Gb/akrein

NovaSeq 6000

SP Flow klefi (2 brautir)

PE250

Flæðisfrumur

Einbreið braut

Akrein að hluta

325-400 M lestur / Akrein

S4 flæðisfrumur (4 brautir)

PE150

Flæðisfrumur

Einbreið braut

Akrein að hluta

~800 Gb / akrein

Dæmi um kröfur

 

Gagnamagn (X)

Styrkur (qPCR/nM)

Bindi

Akreinaröð að hluta

 

 

X ≤ 10 Gb

≥ 1 nM

≥ 25 μl

10 Gb < X ≤ 50 Gb

≥ 2 nM

≥ 25 μl

50 Gb < X ≤ 100 Gb

≥ 3 nM

≥ 25 μl

X > 100 Gb

≥ 4 nM

≥ 25 μl

Akreinaröðun

Per Lane

≥ 1,5 nM / Bókasafnslaug

≥ 25 μl / Bókasafnslaug

Auk styrks og heildarmagns er einnig krafist viðeigandi toppmynsturs.

Athugið: Akreinaröðun bókasöfna með litlum fjölbreytileika krefst PhiX spike-in til að tryggja öflugt grunnsímtal.

Við mælum með því að senda inn fyrirfram sameinuð bókasöfn sem sýnishorn. Ef þú krefst þess að BMKGENE framkvæmi samsöfnun bókasafna, vinsamlegast vísaðu til

kröfur bókasafnsins um röðun akreina að hluta.

Bókasafnsstærð (hámarkskort)

Aðaltoppurinn ætti að vera innan við 300-450 bp.
Bókasöfn ættu að hafa einn aðaltopp, enga millistykkismengun og enga primer dimera.

Vinsamlegast hafðu samband við okkur ef sýnin þín uppfylla ekki kröfur um upphafsefni.

Þjónustuverkflæði

undirbúningur sýna

Gæðaeftirlit bókasafns

Röðun

Röðun

Gagnagreining

Gæðaeftirlit gagna

Dæmi um QC

Verkefnaafhending


  • Fyrri:
  • Næst:

  • Bókasafn QC skýrsla

    Skýrsla um gæði safnsins er gefin fyrir raðgreiningu, mat á magni safns og sundrun.

     

    Röð QC skýrsla

     

    Tafla 1. Tölfræði um raðgreiningargögn.

    Sýnishorn

    BMKID

    Hrá les

    Óunnin gögn (bp)

    Hrein lesning (%)

    Q20(%)

    Q30(%)

    GC(%)

    C_01

    BMK_01

    22.870.120

    6.861.036.000

    96,48

    99,14

    94,85

    36,67

    C_02

    BMK_02

    14.717.867

    4.415.360.100

    96,00

    98,95

    93,89

    37.08

    Mynd 1. Gæðadreifing eftir lestri í hverju sýni

    A9

    Mynd 2. Grunnefnisdreifing

    A10

    Mynd 3. Dreifing lesins efnis í raðgreiningargögnum

    A11

     

    fáðu tilboð

    Skrifaðu skilaboðin þín hér og sendu okkur

    Sendu skilaboðin þín til okkar: