Osisi / Anụmanụ dum Genome Sequng
Atụmatụ Ọrụ
● A na-akwadebe ọkwa nwere ike ịbụ ọkọlọtọ ma ọ bụ pcr-Free
Enly dị na nyiwe 4 nke 4 dị iche iche: MGI LEVASQ, MGI T7, Nanopore Mgbasa Ozi P48, ma ọ bụ Pacbio Revo.
Nnyocha Bioinnatic na-elekwasị anya na nchọpụta nke ọdịiche: SNP, indel, SV na CNV
Uru bara uru
●Nnukwu nka na ndekọ mbipụta: Ahụmahụ chikọtara ọnụ na usoro ihe karịrị otu ihe karịrị 1000, arụpụtala ihe karịrị 1000 bipụtara n'okwu gbasara ihe karịrị 5000.
●Nyocha nke nyocha: Gụnyere ọkpụkpọ mgbanwe ma na-arụ ọrụ.
Nkwado Azụmaahịa:Nraranye anyị na-agbatị gafere ọrụ na-emecha na oge ọrụ ọnwa atọ. N'oge a, anyị na-enye enyemaka na-esochi, enyemaka nsogbu, na Q & A na-ekwu maka ajụjụ ọ bụla metụtara nsonaazụ ya.
●Nnabata zuru oke: Anyị na-eji ọdụ data ọtụtụ iji kpochapụ mkpụrụ ndụ ihe nketa ya na ọdịiche dị iche iche ma mee nyocha nke kwekọrọ na ọtụtụ ọrụ nyocha.
Nkọwapụta ọrụ
| A ga-amata ihe dị iche iche | Atụmatụ sequencing | Omimi dị omimi |
| SNP na indel | Ward Ward Novaseq pe150 ma ọ bụ MGI T7 | 10x |
| SV na CNV (obere eziokwu) | Iri 30x | |
| SV na CNV (nke ziri ezi) | Nanopore Ekwere P48 | 20X |
| SNPs, ụmụ nwanyị, SV na CNV | Pacbio revo | 10x |
Nlele Nyere
| Anụ ahụ ma ọ bụ wepụta nucleic acid | Ward Ward / mgi | Nanopore | Pacbio
| ||
| Anumanu viscera | 0.5-1 g | ≥ 35 g
| ≥ 35 g
| ||
| Akwara anụmanụ | 5 g
| 5 g
| |||
| Ọbara mammalian | 1.5 ml | ≥ 0,5 ml
| ≥ 5 ml
| ||
| Ọkọlọ ọkụkọ / azụ | ≥ 0.1 ml
| ≥ 0,5 ml
| |||
| Osisi dị ọhụrụ | 1-2 g | ≥ 2 g
| 5 g
| ||
| Mkpụrụ ndụ ndị ọzọ |
| ≥ 1x107
| ≥ 1x108
| ||
| Anụ ahụ dị nro / onye ọ bụla | 0.5-1 g | ≥ 1 g
| ≥ 3 g
| ||
| Ewepụtara DNA
| Ileda: ≥ 1 NG / μl Ego: ≥ 30 ng Amachi ma ọ bụ enweghị mmerụ ahụ ma ọ bụ mmerụ ahụ
| Ntinye echiche Ego
OD260 / 280
OD260 / 230
Amachi ma ọ bụ enweghị mmerụ ahụ ma ọ bụ mmerụ ahụ
| ≥ 40 NG / μl 4 μg / Pell Cell / Nlele
1.7-2.2
≥1.5 | Ntinye echiche Ego
OD260 / 280
OD260 / 230
Amachi ma ọ bụ enweghị mmerụ ahụ ma ọ bụ mmerụ ahụ | ≥ 50 NG / μl 10 μg / Pell Cell / Nlele
1.7-2.2
1.8-2.5 |
| Nkwadebe ọbá akwụkwọ Pcr-Free: Isgement tụbara 40 NG / μl Ego ruru 500 ng | |||||
Ọrụ Ọrụ
Nyefe Inye Aka
Mmịpụta DNA
Ọbá Akwụkwọ Ewu
Sequencing
Nyocha data
Nnyefe data
Gụnyere nyocha ndị a:
- Njikwa data dị mma
- Ọnụ ọgụgụ nke itinye aka na Genome
- Nchọpụta dịgasị iche: SNP, indel, SV na CNV
- Na-arụ ọrụ na-arụ ọrụ nke dị iche iche
Ndekọ usoro iji tụọ aka na mkpụrụ ndụ Keynome - nkesa
SNP na-akpọ n'etiti ọtụtụ nlele
Njirimara inver - ọnụ ọgụgụ nke indel ogologo na mpaghara CDD na mpaghara ihe oyiyi mkpụrụ osisi
Nkebi nke dịgasị iche iche
Egosipụta ihe nke mkpụrụ ndụ ihe nketa arụ ọrụ site na njirimara dị iche iche - Gene Ontology
Chai, Q. et al. (2023) 'Crafeese s-transsene na-ekpebi ifuru petallition site na ijikwa mkpokọta antheryaning na owu' (2), p. 433. 10.1111 / PBI.13965.
Cheng, H. et al. (2023) 'chromosome ọhịa HEVEA Brasiliensis Genome na-enye ozuzu ozuzu na nke bara uru maka ụdị roomic na-enyere aka' (5), pp 1058-1072. DI: 10.111 / PBI.14018.
Li, A. et al. (2021) 'mkpụrụ olime nke opori nke na-enye nghọta na mmetụta ihu igwe na eriri na-emegharị', nkwukọrịta ozi nyocha nke ọnwa 2021, 4 (1), pp. 1-12. DI: 10,1038 / S42003-021-02823-6.
Zeng, t. et al. (2022) 'Nyocha nke General na methylation na ụmụ oke ụmụ amaala chiri anya na-enye nghọta maka nchekwa ụdị' (1), pp. 1-12. DI: 10.1038 / S42003-022-03907-7.
