mRNA-seq (NGS) - De novo

Usoro mRNA na-enye ohere ịkọwapụta transcript mRNA niile dị na sel n'okpuru ọnọdụ akọwapụtara ma bụrụ teknụzụ a na-ejikarị eme ihe na mpaghara nyocha dị iche iche. Ezubere pipeline BMKCloud De novo mRNA-seq iji nyochaa ọba akwụkwọ usoro ihe mejupụtara poly-A mgbe enweghị genome ntụaka dị. Pipeline na-amalite site na njikwa mma, sochiri yade novomgbakọ transcript na unigene set nhọrọ. Ntụle nhazi usoro unigene na-ebu amụma usoro ntinye koodu (CDS) na usoro dị mfe ikwugharị (SSR). N'ikpeazụ, nchọpụta okwu dị iche iche na-achọta mkpụrụ ndụ ihe nketa egosipụtara dị iche iche (DEGs) n'etiti ọnọdụ a nwalere, na-esote nkọwa ọrụ na ịba ụba nke DEGs iji wepụta nghọta nke ndu.