Njedebe Nnọkọ Hi-C.
Ndewo-c bụ usoro emere iji weghara nhazi Chromosome site na ijikọ ihe na-akpali akpali na usoro dị elu. A na-ekwe ka ike nke mmekọrịta ndị a kwekọrị ka ọ bụrụ akụkụ anụ ahụ na chromosomes. Ya mere, a na-eji data Hi-C na-eduzi ịmịkọrọ ọnụ, ịtụ, na idozigharị usoro nke usoro na mpempe akwụkwọ ụfọdụ nke chromosom. Teknụzụ a na-enye ike Chromosome nzukọ nke chromosome na enweghị eserese nke mkpụrụ ndụ nke mkpụrụ ndụ. Otu ọ bụla na-achọ Hi-c.
Atụmatụ Ọrụ
● Cowencing na Wind Lightq na pe150.
● Ọrụ chọrọ ihe nlele anụ ahụ, kama wepụtara nucleic acid, na iji njikọ na formaldehyde ma chekwaa mmekorita nke fna-protein.
Nnwale Hi-cm na-emetụta mmachi na-arụzigharị nke nnyapade na biotin, na-esochi cilings nke sọọsọ ya na-akwụsị mgbe ị na-echekwa nchịkọta ahụ. A na-eji DNA na-adọta ya na bedtervidin beaps ma dị ọcha maka nkwadebe ọbá akwụkwọ na-esote.
Uru bara uru
Isi nke Hi-c
(Libeberman-Aidden E Em.,Sayensi, 2009)
●Na-ewepụ mkpa ọ dị maka mkpụrụ ndụ ihe nketa:Hi-c na-eji ozi dị mkpa achọrọ maka arịgonig condoring.
●Nnukwu akara dị elu:na-eduga na ọkwa mgbago elu dị elu karịa 90%.
●Nnukwu nkà na ndekọ mbipụta:BMKGEN nwere nnukwu ahụmịhe dị ukwuu na ihe karịrị 2000 nke nzukọ okike Hi-C. 1000 dị iche iche na ụtụ isi dị iche iche. Ihe karịrị narị ise bipụtara nwere mmetụta mkpokọ ihe karịrị 2000.
●Ndị otu Bioinformask nke ukwuu:Mụ na ndị ọrụ ụlọ na nwekọrịtara maka nyocha Hi-C.
●Nkwado Azụmaahịa:Nraranye anyị na-agbatị gafere ọrụ na-emecha na oge ọrụ ọnwa atọ. N'oge a, anyị na-enye enyemaka na-esochi, enyemaka nsogbu, na Q & A na-ekwu maka ajụjụ ọ bụla metụtara nsonaazụ ya.
●Nnabata zuru oke: Anyị na-eji ọdụ data ọtụtụ iji kpochapụ mkpụrụ ndụ ihe nketa ya na ọdịiche dị iche iche ma mee nyocha nke kwekọrọ na ọtụtụ ọrụ nyocha.
Nkọwapụta ọrụ
| Nkwadebe Ọb | Atụmatụ sequencing | Mmepụta data a tụrụ aro | Njikwa Dị Mma |
| Ndepụta Li-C | Ward Ward Novaseq pe150 | 100X | Q30 ≥ 85% |
Nlele Nyere
| Ahummadu | Ego achọrọ |
| Anumanu viscera | ≥ 2 g |
| Akwara anụmanụ | |
| Ọbara mammalian | ≥ 2 ml |
| Ọkọlọ ọkụkọ / azụ | |
| Osisi dị ọhụrụ | ≥ 3 g |
| Mkpụrụ ndụ ndị ọzọ | ≥ 1x107 |
| Ahuhu | ≥ 2 g |
Ọrụ Ọrụ
Nchọpụta nnwale
Nyefe Inye Aka
Ọbá Akwụkwọ Ewu
Sequencing
Nyocha data
Ọrụ Ahịa
1) Data data QC
2) Hi-clog QC: Atụmatụ nke mmekọrịta dị mma Hi-C
3) Hi-C Ngbakọ: Cormasting nke Contigs ke otu, na-esochi ya n'usoro nke ọ bụla na kenye usoro nchịkọta
4) Hi-cm
Ndewo Li-C CC - Atụmatụ nke Hi-C
Nnọkọ Hi-C.
Nyochaa Mgbakọ Post - HeatMap nke ike mgbaàmà n'etiti bins
Nyochaa ọdụ ahụ na-eme ka ọrụ mgbakọ nke BMKGGEN site na ọrụ mgbakọ BMKGGEN site na nchịkọta nke akwụkwọ.
Tian, t. e et al. (2023) 'Nzukọ General na mkpụrụ ndụ ihe nketa nke ụkọ mmiri na-eguzogide ọgwụ na-eguzogide ọgwụ ọnụ', nke mkpụrụ ndụ mkpụrụ ndụ 2023: 3, 55 (3), pp. 496-506. DI: 10.1038 / S41588-023-01297-y.
Wang, zl et al. (2020) 'Njedebe nke chromosome nke Asia Honeybee APIME', ndị na-ebu ibu na mkpụrụ osisi, 11, p. 524140. DI: 10.3389 / FGEEENENO.2020.00279 / BibTex.
Zhang, F. et al. (2023) 'Na-ekpughe mmalite nke Bookynthes alkaloyo site na inyocha ihe abụọ na ezinụlọ Solanaceae', onye na-ahụ maka okike 2023: 1, 14 (1), pp. 1-18. doi: 10.1038/s41467-023-37133-4.
Zang, X. et al. (2020) Geninas nke osisi banya na pollinator na-enye nghọta n'ime Cel-isp covevings ", 4), ph 875-889.e17. DI: 10.1016 / j.Cell.2020.09.043
