Mmekọrịta HE-C
Atụmatụ Ọrụ
● Cowencing na Wind Lightq na pe150.
● Ọrụ chọrọ ihe nlele anụ ahụ, kama wepụtara nucleic acid, na iji njikọ na formaldehyde ma chekwaa mmekorita nke fna-protein.
Nnwale Hi-cm na-emetụta mmachi na-arụzigharị nke nnyapade na biotin, na-esochi cilings nke sọọsọ ya na-akwụsị mgbe ị na-echekwa nchịkọta ahụ. A na-eji DNA na-adọta ya na bedtervidin beaps ma dị ọcha maka nkwadebe ọbá akwụkwọ na-esote.
Uru bara uru
●Ezigbo mmachi Enzyme: Iji hụ na arụmọrụ dị elu na ụdị dị iche iche na ụdị mmekọrịta dị elu 93%.
●Nnukwu nkà na ndekọ mbipụta:BMKGane nwere ahụmịhe buru ibu na> 2000 Hi-carting Project site na ụdị dị iche iche na ụtụ isi dị iche iche. Ihe karịrị 100 ikpe bipụtara na nchịkọta ihe karịrị 900.
●Ndị otu Bioinformask nke ukwuu:Mụ na pagelọ ọrụ ụlọ na nwekọba ihe maka nyocha Hi-C na nyocha data na nlele data nke nlele anya.
●Nkwado Azụmaahịa:Nraranye anyị na-agbatị gafere ọrụ na-emecha na oge ọrụ ọnwa atọ. N'oge a, anyị na-enye enyemaka na-esochi, enyemaka nsogbu, na Q & A na-ekwu maka ajụjụ ọ bụla metụtara nsonaazụ ya.
●Nnabata zuru oke: Anyị na-eji ọdụ data ọtụtụ iji kpochapụ mkpụrụ ndụ ihe nketa ya na ọdịiche dị iche iche ma mee nyocha nke kwekọrọ na ọtụtụ ọrụ nyocha.
Nkọwapụta ọrụ
| Oba akwukwo | Atụmatụ sequencing | Mmepụta data a tụrụ aro | Njere Hi-C |
| Ndepụta Li-C | With Wardy Pe150 | Chromatin loop: 150x Tad: 50x | Chromatin loop: 10kb Tad: 40kb |
Ọrụ chọrọ
| Ụdị atụ | Ego achọrọ |
| Anụ ahụ | ≥2g |
| Ọbara niile | ≥2ml |
| Fungi | ≥1g |
| Osisi na-eto eto | 1G / Aliquot, 2-4 Agwọ Ahịa tụrụ aro |
| Mkpụrụ ndụ ndị ọzọ | ≥1x107 |
Gụnyere nyocha ndị a:
● Daw data QC;
● Ibe akwukwo na Hi-cary QC: Njikọ mmekọrịta dị mma na njikọta mmebi iwu (NJ);
● Mmekọ mkpụrụ olili anya: CIS / transsis nyocha na de-na-esochi map;
Accchọpụta nke nkesa A / B.
Nchọpụta nke tads na chromatin loops;
Nnyocha dị iche iche na ihe ndị dị 3d Chromatin dị n'etiti ihe nlele na njikọta ọrụ kwekọrọ na mkpụrụ ndụ ihe nkekọ.
CIS na transpetra nkesa
Kpochapu nke chromosiman
Keline-sara mbara nke akuku A / B
Kelit-sara mbara nke Chromatin loops
Nlele nke tads
Nyochaa nyocha nyocha ahụ site na ọrụ Hi-C CTE site na nchịkọta nke akwụkwọ.
Meng, t. et al. (2021) 'A na-achọpụta nyocha nke ihe ndị mere ọtụtụ ihe dị ka ebumnuche akwụkwọ akụkọ maka chordoma',Neuro-oncology, 23 (10), Pp. 1709-1722. DI: 10.1093 / Neuonc / Noab156.
XU, L. et al. (2021) '3d consunganization na nkwụsị nke mkpụrụ ndụ mkpụrụokwu na-enye nghọta na Pathogenenesis, nanopore, na RNA na-achọpụta',National Medica B, 11 (10), pp 3150-3164. DI: 10.1016 / J.APPB.2021.03.022.
