Sequencing Transkriptom Seluruh - Illumina
Fitur
● Perpustakaan ganda untuk mengurutkan transkriptom lengkap: penipisan rRNA diikuti oleh persiapan perpustakaan PE150 dan pemilihan ukuran diikuti oleh persiapan perpustakaan SE50
● Analisis bioinformatika lengkap mRNA, lncRNA, circRNA, dan miRNA dalam laporan bioinformatika terpisah
● Analisis bersama semua ekspresi RNA dalam laporan gabungan, termasuk analisis jaringan CERNA.
Keuntungan Layanan
●Analisis mendalam tentang jaringan pengatur: Analisis jaringan CERNA diaktifkan oleh sekuensing bersama mRNA, lncRNA, circRNA, dan miRNA dan oleh alur kerja bioinformatik yang lengkap.
●Anotasi komprehensif: Kami menggunakan beberapa database untuk secara fungsional membuat anotasi gen yang diekspresikan secara berbeda (DEG) dan melakukan analisis pengayaan yang sesuai, memberikan wawasan ke dalam proses seluler dan molekuler yang mendasari respons transkriptome.
●Keahlian yang luas: Dengan rekam jejak yang berhasil menutup lebih dari 2100 proyek transkriptome seluruh dalam berbagai domain penelitian, tim kami membawa banyak pengalaman ke setiap proyek.
●Kontrol kualitas yang ketat: Kami menerapkan titik kontrol inti di semua tahap, dari sampel dan persiapan perpustakaan hingga pengurutan dan bioinformatika. Pemantauan yang cermat ini memastikan pengiriman hasil berkualitas tinggi secara konsisten.
●Dukungan pasca-penjualan: Komitmen kami melampaui penyelesaian proyek dengan periode layanan setelah penjualan 3 bulan. Selama waktu ini, kami menawarkan tindak lanjut proyek, bantuan pemecahan masalah, dan sesi tanya jawab untuk menangani pertanyaan apa pun yang terkait dengan hasilnya
Persyaratan dan pengiriman sampel
| Perpustakaan | Strategi Sequencing | Data direkomendasikan | Kontrol kualitas |
| rRNA habis | Illumina PE150 | 16 GB | Q30 ≥85% |
| Ukuran dipilih | Illumina SE50 | 10-20m dibaca |
Persyaratan Sampel:
Nukleotida:
| Conc. (Ng/μl) | Jumlah (μg) | Kemurnian | Integritas |
| ≥ 80 | ≥ 1.6 | OD260/280 = 1.7-2.5 OD260/230 = 0,5-2.5 Kontaminasi protein atau tidak ada protein atau DNA yang ditunjukkan pada gel. | Rin≥6.0 5.0≥28S/18S≥1.0; ketinggian terbatas atau tidak ada |
Pengiriman sampel yang disarankan
Wadah: 2 ml tabung centrifuge (timah tidak disarankan)
Label sampel: grup+replikasi misalnya A1, A2, A3; B1, B2, B3.
Pengiriman:
1. Es kering: Sampel perlu dikemas dalam kantong dan dikubur dalam es kering.
2. Tabung RNASTABLE: Sampel RNA dapat dikeringkan dalam tabung stabilisasi RNA (misalnya Rnastable®) dan dikirim pada suhu kamar.
Aliran kerja layanan
Desain Eksperimen
Pengiriman sampel
Ekstraksi RNA
Konstruksi Perpustakaan
Sekuensing
Analisis Data
Layanan setelah penjualan
Bioinformatika
Tinjauan Ekspresi RNA
Gen yang diekspresikan secara berbeda
Analisis Cerna
MiRNA yang diekspresikan secara berbeda dan RNA terkait
Jelajahi kemajuan penelitian yang difasilitasi oleh seluruh layanan sekuensing transkriptome BMKGENE melalui kumpulan publikasi yang dikuratori.
Dai, Y. et al. (2022) 'Profil ekspresi komprehensif mRNA, lncrnas dan miRNA pada penyakit Kashin-beck yang diidentifikasi oleh RNA-sequencing', molekul omics, 18 (2), hlm. 154–166. doi: 10.1039/d1mo00370d.
Liu, N. Nan et al. (2022) 'Analisis Transkriptom Panjang Penuh Tahan Dingin Apis cerana di Gunung Changbai selama periode musim dingin.', Gene, 830, hlm. 146503–146503. doi: 10.1016/j.gene.2022.146503.
Wang, XJ et al. (2022) 'Prioritas berbasis integrasi multi-omics dari jaringan regulasi RNA endogen yang bersaing pada kanker paru-paru sel kecil: karakteristik molekuler dan kandidat obat', perbatasan dalam onkologi, 12, hal. 904865. Doi: 10.3389/fonc.2022.904865/Bibtex.
Xu, P. et al. (2022) 'Analisis terintegrasi profil ekspresi lncRNA/circRNA-miRNA-mRNA mengungkapkan wawasan baru tentang mekanisme potensial dalam menanggapi nematoda root-simpul dalam kacang tanah', genomik BMC, 23 (1), hlm. 1-12. doi: 10.1186/s12864-022-08470-3/angka/7.
Yan, Z. et al. (2022) 'Sequencing RNA seluruh transkriptome menyoroti mekanisme molekuler yang terkait dengan pemeliharaan kualitas pascapanen dalam brokoli oleh iradiasi LED merah', biologi dan teknologi pascapanen, 188, hal. 111878. Doi: 10.1016/j.postharvbio.2022.111878.
