Sequencing-Illumina kecil
Fitur
● Persiapan perpustakaan mencakup langkah pemilihan ukuran
● Analisis bioinformatik berpusat di sekitar prediksi miRNA dan targetnya
Keuntungan Layanan
●Analisis Bioinformatika Komprehensif:Mengaktifkan identifikasi miRNA yang diketahui dan baru, identifikasi target miRNA, dan anotasi fungsional yang sesuai dan pengayaan dengan beberapa database (KEGG, GO)
●Kontrol kualitas yang ketat: Kami menerapkan titik kontrol inti di semua tahap, dari sampel dan persiapan perpustakaan hingga pengurutan dan bioinformatika. Pemantauan yang cermat ini memastikan pengiriman hasil berkualitas tinggi secara konsisten.
●Dukungan pasca-penjualan: Komitmen kami melampaui penyelesaian proyek dengan periode layanan setelah penjualan 3 bulan. Selama waktu ini, kami menawarkan tindak lanjut proyek, bantuan pemecahan masalah, dan sesi tanya jawab untuk menangani setiap pertanyaan yang terkait dengan hasilnya.
●Keahlian yang luas: Dengan rekam jejak yang berhasil ditutup pada beberapa proyek SRNA yang mencakup lebih dari 300 spesies di berbagai domain penelitian, tim kami membawa banyak pengalaman untuk setiap proyek.
Persyaratan dan pengiriman sampel
| Perpustakaan | Platform | Data yang disarankan | Data QC |
| Ukuran dipilih | Illumina SE50 | 10m-20m dibaca | Q30 ≥85% |
Persyaratan Sampel:
Nukleotida:
| Conc. (Ng/μl) | Jumlah (μg) | Kemurnian | Integritas |
| ≥ 80 | ≥ 0,8 | OD260/280 = 1.7-2.5 OD260/230 = 0,5-2.5 Kontaminasi protein atau tidak ada protein atau DNA yang ditunjukkan pada gel. | Rin≥6.0; 5.0≥28S/18S≥1.0; ketinggian terbatas atau tidak ada |
● Tanaman:
Root, batang atau kelopak: 450 mg
Daun atau biji: 300 mg
Buah: 1.2 g
● Hewan:
Jantung atau usus: 450 mg
Viscera atau Brain: 240 mg
Otot: 600 mg
Tulang, Rambut atau Kulit: 1.5g
● Arthropoda:
Serangga: 9g
Crustacea: 450 mg
● Darah utuh: 2 tabung
● Sel: 106 sel
● Serum dan plasma:6 ml
Pengiriman sampel yang disarankan
Wadah: 2 ml tabung centrifuge (timah tidak disarankan)
Label sampel: grup+replikasi misalnya A1, A2, A3; B1, B2, B3.
Pengiriman:
1. Es kering: Sampel perlu dikemas dalam kantong dan dikubur dalam es kering.
2. Tabung RNASTABLE: Sampel RNA dapat dikeringkan dalam tabung stabilisasi RNA (misalnya RNASTABLE®) dan dikirim dalam suhu kamar.
Aliran kerja layanan
Desain Eksperimen
Pengiriman sampel
Ekstraksi RNA
Konstruksi Perpustakaan
Sekuensing
Analisis Data
Layanan setelah penjualan
Bioinformatika
● Kontrol kualitas data mentah
● Klasifikasi SRNA
● Alignment ke genom referensi
● Identifikasi miRNA yang diketahui dan baru
● Analisis ekspresi miRNA diferensial
● Anotasi fungsional target miRNA
Identifikasi miRNA: Struktur dan Kedalaman
Ekspresi diferensial miRNA - Clustering Hiarchical
Anotasi fungsional target miRNA yang diekspresikan secara berbeda
Jelajahi kemajuan penelitian yang difasilitasi oleh layanan sekuensing SRNA BMKGENE melalui kumpulan publikasi yang dikuratori.
Chen, H. et al. (2023) 'Infeksi virus menghambat biosintesis saponin dan fotosintesis di Panax notoginseng', fisiologi tanaman dan biokimia, 203, hal. 108038. Doi: 10.1016/j.plaphy.2023.108038.
Li, H. et al. (2023) 'Protein Free1 yang mengandung domain Fyve yang mengandung domain dengan komponen mikroprosesor untuk menekan biogenesis miRNA', EMBO Reports, 24 (1). doi: 10.15252/empl.202255037/Suppl_file/empl202255037-SUP-0004-sdatafig4.tif.
Yu, J. et al. (2023) 'MicroRNA AME-BANTAM-3P mengontrol pengembangan kepompong larva dengan menargetkan beberapa gen seperti faktor pertumbuhan epidermal 8 gen (MEGF8) di lebah madu, APIS mellifera', International Journal of Molecular Sciences, 24 (6), P . 5726. DOI: 10.3390/IJMS24065726/S1.
Zhang, M. et al. (2018) 'Analisis terintegrasi miRNA dan gen yang terkait dengan kualitas daging mengungkapkan bahwa GGA-MIR-140-5p mempengaruhi deposisi lemak intramuskuler pada ayam', fisiologi seluler dan biokimia, 46 (6), hlm. 2421-2433. doi: 10.1159/000489649.
