Produk

Mengambil data sequencing isoform Pacific Biosciences (PACBIO) sebagai input, aplikasi ini dapat mengidentifikasi urutan transkrip panjang penuh (tanpa perakitan). Dengan memetakan urutan panjang penuh terhadap genom referensi, transkrip dapat dioptimalkan oleh gen yang diketahui, transkrip, daerah pengkodean, dll. Dalam hal ini, identifikasi struktur mRNA yang lebih akurat, seperti splicing alternatif, dll, dapat dicapai. Analisis bersama dengan data sekuensing transkriptome NGS memungkinkan anotasi yang lebih komprehensif dan kuantifikasi yang lebih akurat dalam ekspresi pada tingkat transkrip, yang sebagian besar menguntungkan ekspresi diferensial hilir dan analisis fungsional.