Transkriptome penuh PACBIO

Sequencing transkriptome full-length PACBIO, isoseq, memungkinkan identifikasi akurat dari isoform transkrip, menjelaskan cahaya pada poliadenilasi dan penyambungan alternatif, dan mengarah ke analisis ekspresi gen yang lebih akurat. Pipa transkriptome full-length BMKCloud Pacbio dirancang untuk menganalisis pustaka cDNA yang diurutkan dalam mode sekuensing konsensus sirkuler (CCS) dan mengidentifikasi sekuens non-scheric (FLNC) full-length, yang kemudian dikelompokkan ke dalam transkrip non-redundan. Analisis Busco berikutnya menilai kelengkapan perakitan transkriptome. Dari transkriptom yang dirakit, beberapa analisis dilakukan: splicing alternatif, pengulangan urutan sederhana (SSR), prediksi lncRNA dan gen target yang sesuai, prediksi gen baru, analisis keluarga gen, analisis faktor transkripsi, dan anotasi fungsional transkrip.