
mRNA-seq (NGS) dengan genom referensi
RNA-seq adalah alat standar di seluruh ilmu kehidupan dan tanaman, menjembatani kesenjangan antara genom dan proteom. Kekuatannya terletak pada menemukan transkrip baru dan mengukur ekspresi mereka dalam satu pengujian. Ini banyak digunakan untuk studi transkriptomik komparatif, menyoroti gen yang terkait dengan berbagai sifat atau fenotipe, seperti membandingkan mutan dengan tipe liar atau mengungkapkan ekspresi gen dalam kondisi tertentu. BMKCloud mRNA (Referensi) APP mengintegrasikan kuantifikasi ekspresi, analisis ekspresi diferensial (DEG), dan analisis struktur urutan ke dalam pipa bioinformatika mRNA-seq (NGS) dan menggabungkan kekuatan perangkat lunak yang sama, memastikan kenyamanan dan keramahan pengguna. Pengguna dapat mengunggah data RNA-seq mereka ke cloud, di mana aplikasi menawarkan solusi analisis bioinformatik satu atap yang komprehensif. Selain itu, ini memprioritaskan pengalaman pelanggan, menawarkan operasi yang dipersonalisasi yang disesuaikan dengan kebutuhan spesifik pengguna. Pengguna dapat menetapkan parameter dan mengirimkan misi pipa sendiri, memeriksa laporan interaktif, melihat data/diagram dan penambangan data lengkap, seperti: pemilihan gen target, pengelompokan fungsional, diagram, dll.
Platform:Illumina, MGI
Strategi:RNA-seq
Tata letak: Pariasi, data bersih.
Jenis Perpustakaan:fr-unstranded, fr-firststrand atau fr-secondstrand
Baca Panjang:150 bp
Jenis file:*.fastq, *.fq, *.fastq.gz atau *.fq.gz. Sistem akanPasangkan file .fastQ secara otomatis sesuai dengan nama file mereka,misalnya *_1.fastq dipasangkan dengan *._ 2.fastq.
Jumlah sampel:Tidak ada batasan pada nomor tersebutsampel, tetapi waktu analisis akan meningkat sebagai jumlahSampel tumbuh.
Jumlah data yang disarankan:6g per sampel