Genom
Majelis dan analisis skala kromosom dari genome biomassa miscanthus lutarioriparius genome
Sequencing Nanopore | Illumina | Hi-C | RNA-sequencing | Filogeni
Dalam penelitian ini, teknologi biomarker memberikan dukungan teknis pada sekuensing nanopore, perakitan genom de novo, perakitan bantuan HI-C, dll.
Abstrak
Miscanthus, tanaman abadi rhizomatous, memiliki potensi besar untuk produksi bioenergi untuk biomassa tinggi dan toleransi stres. Kami melaporkan perakitan skala kromosomMiscanthus lutarioripariusGenom dengan menggabungkan Sequencing Nanopore Oxford dan Teknologi HI-C. Rakitan 2,07-GB mencakup 96,64% dari genom, dengan Contig N50 1,71 MB. Urutan sentromer dan telomer dikumpulkan untuk semua 19 kromosom dan kromosom 10, masing -masing. Asal allotetraploid dari M. lutarioriparius diyakinkan menggunakan pengulangan satelit sentromerik. Struktur genom tetraploid dan beberapa pengaturan ulang kromosom relatif terhadap sorgum ditunjukkan dengan jelas. Gen duplikat tandemM. Lutarioripariusdiperkaya fungsional tidak hanya dalam hal yang terkait dengan respons stres, tetapi juga biosintesis dinding sel. Keluarga gen yang terkait dengan resistensi penyakit, biosintesis dinding sel dan transportasi ion logam sangat diperluas dan berkembang. Perluasan keluarga -keluarga ini mungkin merupakan dasar genomik yang penting untuk peningkatan sifat -sifat luar biasaM. Lutarioriparius.
Statistik utama perakitan genom
Angka. Tinjauan Umum Majelis Genom M. Lutarioriparius
Berita dan Sorotan Bertujuan untuk berbagi kasus -kasus sukses terbaru dengan teknologi biomarker, menangkap pencapaian ilmiah baru serta teknik -teknik terkemuka yang diterapkan selama penelitian.
Waktu posting: Jan-05-2022