mRNA-seq (NGS) – Baru-baru ini

Pengurutan mRNA memungkinkan pembuatan profil semua transkrip mRNA dalam sel dalam kondisi tertentu dan merupakan teknologi yang banyak digunakan di berbagai bidang penelitian. Pipeline BMKCloud De novo mRNA-seq dirancang untuk menganalisis pustaka sequencing yang diperkaya poli-A ketika tidak ada genom referensi yang tersedia. Prosesnya dimulai dengan kontrol kualitas, diikuti olehde novoperakitan transkrip dan pemilihan set unigene. Analisis struktur unigene memprediksi urutan pengkodean (CDS) dan pengulangan urutan sederhana (SSR). Selanjutnya, analisis ekspresi diferensial menemukan gen yang diekspresikan secara berbeda (DEG) di antara kondisi yang diuji, diikuti dengan anotasi fungsional dan pengayaan DEG untuk mengekstraksi wawasan biologis.