Metagenomics (NGS)

Metagenomik senapan dengan Illumina adalah alat yang populer untuk mempelajari mikrobioma dengan secara langsung mengurutkan DNA dari sampel kompleks, memungkinkan studi tentang keragaman taksonomi dan fungsional. Pipa BMKCloud metagenomic (NGS) dimulai dengan kontrol kualitas dan perakitan metagenom, dari mana gen diprediksi dan dikelompokkan ke dalam kumpulan data yang tidak berlebihan yang dijelaskan untuk fungsi dan taksonomi menggunakan beberapa database. Informasi ini digunakan untuk menganalisis keanekaragaman taksonomi sampel (keanekaragaman alfa) dan keanekaragaman antar sampel (keragaman beta). Analisis diferensial antara kelompok menemukan fungsi OTU dan biologis yang berbeda antara kedua kelompok yang menggunakan tes parametrik dan non-parametrik, sementara analisis korelasi menghubungkan perbedaan ini dengan faktor lingkungan.