lncrna

RNA non-coding panjang (lncRNA) adalah RNA yang lebih panjang dari 200 nukleotida dengan potensi pengkodean rendah tetapi dengan fungsi pengaturan yang penting. Pipeline lncRNA BMKCloud dirancang untuk menganalisis pustaka rRNA yang telah habis dengan genom referensi berkualitas tinggi yang dianotasi dengan baik, dengan menganalisis ekspresi lncRNA dan mRNA secara bersamaan. Setelah pemangkasan baca dan kontrol kualitas, bacaan diselaraskan dengan genom referensi untuk menyusun transkrip, dan analisis struktur gen selanjutnya mengungkapkan penyambungan alternatif dan gen baru. Transkrip diidentifikasi sebagai mRNA atau lncRNA, dan analisis ekspresi diferensial mengidentifikasi lncRNA yang diekspresikan secara berbeda, targetnya, dan gen yang diekspresikan secara berbeda (DEGS). DEG dan target lncRNA yang diekspresikan secara berbeda diberi anotasi fungsional untuk menemukan kategori fungsional yang diperkaya.