● Dua panel exome yang tersedia berdasarkan pengayaan target dengan probe: pasti pilih manusia semua exon v6 (agilent) dan panel hibridisasi exome xgen v2 (IDT).
● Urutan di Illumina novaseq.
● Pipa bioinformatik yang diarahkan pada analisis penyakit atau analisis tumor.
●Menargetkan daerah pengkode protein: Dengan menangkap dan mengurutkan daerah pengkode protein, HWE digunakan untuk mengungkapkan varian yang terkait dengan struktur protein.
●Biaya Hemat:HWES menghasilkan sekitar 85% dari mutasi terkait penyakit manusia dari 1% dari genom manusia.
●Akurasi tinggi: Dengan kedalaman sekuensing tinggi, HWES memfasilitasi deteksi varian umum dan varian langka dengan frekuensi lebih rendah dari 1%.
●Kontrol kualitas yang ketat: Kami menerapkan lima titik kontrol inti di semua tahap, dari sampel dan persiapan perpustakaan hingga pengurutan dan bioinformatika. Pemantauan yang cermat ini memastikan pengiriman hasil berkualitas tinggi secara konsisten.
●Analisis Bioinformatika Komprehensif: Pipa kami melampaui mengidentifikasi variasi pada genom referensi, karena menggabungkan analisis lanjutan yang dirancang untuk secara khusus menjawab pertanyaan penelitian yang terkait dengan aspek genetik penyakit atau analisis tumor.
●Dukungan pasca-penjualan:Komitmen kami melampaui penyelesaian proyek dengan periode layanan setelah penjualan 3 bulan. Selama waktu ini, kami menawarkan tindak lanjut proyek, bantuan pemecahan masalah, dan sesi tanya jawab untuk menangani setiap pertanyaan yang terkait dengan hasilnya.
Strategi penangkapan ekson | Strategi Sequencing | Output data yang disarankan |
Tentu Pilih Manusia Semua Exon V6 (Agilent) atau panel hibridisasi exome xgen V2 (IDT)
| Illumina Novaseq PE150 | 5 -10 GB Untuk gangguan Mendelian/penyakit langka:> 50x Untuk sampel tumor: ≥ 100x |
Jenis sampel
| Jumlah(QUBIT®)
| Konsentrasi | Volume
| Purity (Nanodrop ™) |
DNA genomik
| ≥ 50 ng | ≥ 6 ng/μl | ≥ 15 μl | OD260/280 = 1.8-2.0 Tidak ada degradasi, tidak ada kontaminasi
|
Analisis bioinformatik sampel hwes-penyakit meliputi:
● Urutan data QC
● Penyelarasan genom referensi
● Identifikasi SNP dan Indels
● Anotasi fungsional SNP dan indels
Analisis bioinformatik sampel tumor meliputi:
● Urutan data QC
● Penyelarasan genom referensi
● Identifikasi SNP, indels dan variasi somatik
● Identifikasi varian germline
● Analisis tanda tangan mutasi
● Identifikasi gen penggerak berdasarkan mutasi gain-of-function
● Anotasi mutasi pada tingkat kerentanan obat
● Analisis heterogenitas - Perhitungan kemurnian dan ploidi
Data QC - Statistik Pengambilan Exome
Identifikasi Varian - Indels
Analisis Lanjutan: Identifikasi dan Distribusi SNP/Indels yang Berfungsi - Plot Circos
Analisis Tumor: Identifikasi dan Distribusi Mutasi Somatik - Plot Circos
Analisis tumor: garis keturunan klon