Analisis Asosiasi Genome-Selebar
Alur kerja
Keuntungan Layanan
●Keahlian dan catatan publikasi yang luas: Dengan akumulasi pengalaman di GWAS, BMKGENE telah menyelesaikan ratusan proyek spesies dalam penelitian populasi GWAS, para peneliti membantu untuk menerbitkan lebih dari 100 artikel, dan faktor dampak kumulatif mencapai 500.
● Analisis Bioinformatika Komprehensif: Alur kerja mencakup analisis asosiasi Trait SNP, memberikan satu set gen kandidat dan anotasi fungsional yang sesuai.
●Tim bioinformatika yang sangat terampil dan siklus analisis pendek: Dengan pengalaman hebat dalam analisis genomik canggih, tim BMKGENE memberikan analisis komprehensif dengan waktu penyelesaian yang cepat.
●Dukungan pasca-penjualan:Komitmen kami melampaui penyelesaian proyek dengan periode layanan setelah penjualan 3 bulan. Selama waktu ini, kami menawarkan tindak lanjut proyek, bantuan pemecahan masalah, dan sesi tanya jawab untuk menangani setiap pertanyaan yang terkait dengan hasilnya.
Spesifikasi dan Persyaratan Layanan
| Jenis pengurutan | Skala populasi yang direkomendasikan | Strategi Sequencing | Persyaratan nukleotida |
| Sequencing seluruh genom | 200 sampel | 10x | Konsentrasi: ≥ 1 ng/ μl Jumlah Total T 30ng Terbatas atau tanpa degradasi atau kontaminasi |
| Fragmen amplifikasi spesifik (SLAF) | Kedalaman tag: 10x Jumlah tag: <400 MB: WGS direkomendasikan <1GB: Tag 100K 1GB > 2GB: Tag 300K Maks 500k Tag | Konsentrasi ≥ 5 ng/μl Jumlah total ≥ 80 ng Nanodrop OD260/280 = 1.6-2.5 Gel Agarose: Tidak ada atau degradasi atau kontaminasi terbatas
|
Pemilihan materi
Varietas yang berbeda, subspesies, landraces/genebanks/keluarga campuran/sumber daya liar
Varietas yang berbeda, subspesies, landrace
Sumber Daya Keluarga Half-Sib/Full-Sib/Sumber Liar
Aliran kerja layanan
Desain Eksperimen
Pengiriman sampel
Ekstraksi RNA
Konstruksi Perpustakaan
Sekuensing
Analisis Data
Layanan setelah penjualan
Termasuk analisis berikut:
- Analisis Asosiasi Genome-Selebar: LM, LMM, Emmax, Model Fastlmm
- Anotasi fungsional gen kandidat
Analisis Asosiasi Trait SNP-Plot Manhattan
Analisis Asosiasi Trait SNP-Plot QQ
Jelajahi kemajuan yang difasilitasi oleh layanan de Gwas BMKGENE melalui kumpulan publikasi yang dikuratori:
LV, L. et al. (2023) 'Wawasan tentang Basis Genetik Toleransi Amonia dalam Razor Clam Sinonovacula Conctricta oleh Genome-Wide Association Study',Akuakultur, 569, hlm. 739351. Doi: 10.1016/j.aquaculture.2023.739351.
Li, X. et al. (2022) 'Analisis multi-omics dari 398 aksesi millet racun mengungkapkan daerah genom yang terkait dengan domestikasi, sifat metabolit, dan efek anti-inflamasi',Tanaman molekuler, 15 (8), hlm. 1367–1383. doi: 10.1016/j.molp.2022.07.003.
Li, J. et al. (2022) 'Pemetaan Asosiasi Genome-Selebar Hulless nyaris tidak fenotip di lingkungan kekeringan',Perbatasan dalam Ilmu Tanaman, 13, hlm. 924892. Doi: 10.3389/fpls.2022.924892/Bibtex.
Zhao, X. et al. (2021) 'GMST1, yang mengkode sulfotransferase, memberikan resistensi terhadap strain virus mosaik kedelai G2 dan G3',Tanaman, sel & lingkungan, 44 (8), hlm. 2777–2792. doi: 10.1111/pce.14066.
