Genetika Evolusi
Keuntungan Layanan
Takagi et al.,Jurnal Tanaman, 2013
●Analisis bioinformatik yang komprehensif:memungkinkan estimasi keragaman genetik, yang mencerminkan potensi evolusi spesies, dan mengungkapkan hubungan filogenetik yang andal antara spesies dengan pengaruh evolusi konvergen dan evolusi paralel yang diminimalkan
●Analisis khusus opsional: seperti estimasi waktu dan kecepatan divergensi berdasarkan variasi pada tingkat nukleotida dan asam amino.
●Keahlian dan catatan publikasi yang luas: BMKGENE telah mengumpulkan pengalaman besar dalam proyek populasi dan genetika evolusi selama lebih dari 15 tahun, mencakup ribuan spesies, dll. Dan berkontribusi pada lebih dari 1000 proyek tingkat tinggi yang diterbitkan di alam komunikasi, tanaman molekuler, jurnal bioteknologi tanaman, dll.
● Tim bioinformatika yang sangat terampil dan siklus analisis pendek: Dengan pengalaman hebat dalam analisis genomik canggih, tim BMKGENE memberikan analisis komprehensif dengan waktu penyelesaian yang cepat.
● Dukungan pasca-penjualan:Komitmen kami melampaui penyelesaian proyek dengan periode layanan setelah penjualan 3 bulan. Selama waktu ini, kami menawarkan tindak lanjut proyek, bantuan pemecahan masalah, dan sesi tanya jawab untuk menangani setiap pertanyaan yang terkait dengan hasilnya.
Spesifikasi dan Persyaratan Layanan
| Jenis pengurutan | Skala populasi yang direkomendasikan | Strategi Sequencing | Persyaratan nukleotida |
| Sequencing seluruh genom | ≥ 30 orang, dengan ≥ 10 orang dari setiap subkelompok
| 10x | Konsentrasi: ≥ 1 ng/ μl Jumlah Total T 30ng Terbatas atau tanpa degradasi atau kontaminasi |
| Fragmen amplifikasi spesifik (SLAF) | Tag Depth: 10x Jumlah tag: <400 MB: WGS direkomendasikan <1GB: Tag 100K 1GB > 2GB: Tag 300K Maks 500k Tag | Konsentrasi ≥ 5 ng/μl Jumlah total ≥ 80 ng Nanodrop OD260/280 = 1.6-2.5 Gel Agarose: Tidak ada atau degradasi atau kontaminasi terbatas
|
Aliran kerja layanan
Desain Eksperimen
Pengiriman sampel
Konstruksi Perpustakaan
Sekuensing
Analisis Data
Layanan setelah penjualan
Layanan mencakup analisis struktur populasi (pohon filogenetik, PCA, grafik stratifikasi populasi), keragaman populasi, dan pemilihan populasi (disekuilibrium hubungan, selektif selektif pemilihan situs yang menguntungkan). Layanan ini juga dapat mencakup analisis khusus (misalnya waktu divergensi, aliran gen).
*Hasil demo yang ditampilkan di sini semua dari genom yang diterbitkan dengan bmkgene
1. Analisis evolusi berisi konstruksi pohon filogenetik, struktur populasi dan PCA berdasarkan variasi genetik.
Pohon filogenetik mewakili hubungan taksonomi dan evolusi antara spesies dengan leluhur yang sama.
PCA bertujuan untuk memvisualisasikan kedekatan antara sub-populasi.
Struktur populasi menunjukkan adanya sub-populasi yang berbeda secara genetik dalam hal frekuensi alel.
Chen, et. al.,PNA, 2020
2. sapuan selektif
Sapuan selektif mengacu pada proses di mana situs yang menguntungkan dipilih dan frekuensi situs netral terkait meningkat dan situs -situs yang tidak terhubung berkurang, menghasilkan pengurangan regional.
Deteksi genom-lebar pada daerah sapuan selektif diproses dengan menghitung indeks genetik populasi （π, fst, tajima d) dari semua SNP dalam jendela geser (100 kb) pada langkah tertentu (10 kb).
Keragaman nukleotida (π）
Tajima d
Indeks Fiksasi (FST)
Wu, et. al.,Tanaman molekuler, 2018
3. Aliran Gen
Wu, et. al.,Tanaman molekuler, 2018
4. Sejarah Demografi
Zhang, et. al.,Ekologi & Evolusi Alam, 2021
5. Waktu Peron
Zhang, et. al.,Ekologi & Evolusi Alam, 2021
Jelajahi kemajuan yang difasilitasi oleh layanan genetika evolusi BMKGENE melalui kumpulan publikasi yang dikuratori:
Hassanyar, Ak et al. (2023) 'Penemuan penanda molekuler SNP dan gen kandidat yang terkait dengan resistensi virus sakral di apis cerana cerana larva dengan resequencing genome seluruh',Jurnal Internasional Ilmu Molekuler, 24 (7). doi: 10.3390/ijms24076238.
Chai, J. et al. (2022) 'Penemuan salamander raksasa Cina yang liar dan murni menciptakan peluang konservasi baru',Penelitian Zoologi, 2022, vol. 43, edisi 3, halaman: 469-480, 43 (3), hlm. 469–480. doi: 10.24272/j.issn.2095-8137.2022.101.
Han, M. et al. (2022) 'Pola Phylogeographical dan Sejarah Evolusi Populasi dari Elymus Sibiricus L. Pribumi di Dataran Tinggi Qinghai-Tibet',Perbatasan dalam Ilmu Tanaman, 13, hlm. 882601. Doi: 10.3389/fpls.2022.882601/Bibtex.
Wang, J. et al. (2022) 'Wawasan Genomik tentang Evolusi Longan dari Majelis Genom Tingkat Kromosom dan Genomik Populasi Akses Lengkak',Penelitian Hortikultura, 9. doi: 10.1093/jam/UHAC021.
