Genetika Evolusioner

Studi genetik evolusi bertujuan untuk memahami lintasan evolusi populasi menggunakan informasi polimorfisme dalam urutan genom. Pipeline Evolutionary Genetics BMKCloud dirancang untuk menganalisis data WGS atau Spesifik-Locus Aplified Fragment (SLAF) dari populasi besar. Setelah kontrol kualitas data mentah, pembacaan diselaraskan dengan genom referensi dan varian dipanggil. Jalur ini mencakup konstruksi pohon filogenetik, analisis komponen utama (PCA), analisis struktur populasi, disekuilibrium keterkaitan (LD), analisis sapuan selektif, dan analisis kandidat gen.